54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1694 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1694  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  248  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1141  hypothetical protein  66.39 
 
 
133 aa  163  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3030  hypothetical protein  53.33 
 
 
140 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0238  hypothetical protein  53.85 
 
 
129 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.973581  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1435  hypothetical protein  50.43 
 
 
130 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0976  hypothetical protein  46.96 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216139  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0902  hypothetical protein  48.76 
 
 
129 aa  113  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000090715  hitchhiker  0.00000319035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2927  hypothetical protein  44.44 
 
 
148 aa  102  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0465  hypothetical protein  43.97 
 
 
125 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2551  hypothetical protein  47.37 
 
 
133 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.311981  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0072  hypothetical protein  42.62 
 
 
134 aa  99  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.0725128 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2929  hypothetical protein  43.7 
 
 
127 aa  97.8  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.20874  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0701  hypothetical protein  38.33 
 
 
137 aa  91.3  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.580234  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2464  hypothetical protein  40.34 
 
 
135 aa  90.5  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1033  hypothetical protein  43.75 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4808  hypothetical protein  39.82 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1568  hypothetical protein  37.61 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214101  normal  0.171245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0879  hypothetical protein  41.44 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374693  hitchhiker  0.0000252652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2568  hypothetical protein  36.75 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.995822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0868  hypothetical protein  38.33 
 
 
125 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1195  hypothetical protein  39.5 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.350794  normal  0.0471945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4353  hypothetical protein  40.91 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1481  hypothetical protein  40.71 
 
 
144 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2540  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-domain  35.45 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1610  hypothetical protein  39.5 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00644955  normal  0.0278049 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0855  GTP-binding signal recognition particle  39.5 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.471576  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2108  hypothetical protein  38.18 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2581  hypothetical protein  35.45 
 
 
125 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2386  hypothetical protein  36.36 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3252  hypothetical protein  39.13 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  hitchhiker  3.08199e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1634  hypothetical protein  35.45 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4372  hypothetical protein  36.94 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000174807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6543  hypothetical protein  40.74 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4311  hypothetical protein  36.04 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1210  hypothetical protein  35.59 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2876  hypothetical protein  36.52 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.585701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0149  hypothetical protein  37.84 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1499  hypothetical protein  36 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00140337  hitchhiker  0.0000264658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1375  hypothetical protein  32.8 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3619  hypothetical protein  32 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1849  hypothetical protein  30.91 
 
 
123 aa  67  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1246  hypothetical protein  34.86 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1333  hypothetical protein  32.77 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879036  normal  0.042363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1620  hypothetical protein  37.04 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0805096  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0167  hypothetical protein  35.92 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1242  hypothetical protein  27.68 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2357  hypothetical protein  31.13 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0657686  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0081  hypothetical protein  33.64 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0943  hypothetical protein  34 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3086  hypothetical protein  41.18 
 
 
53 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1051  hypothetical protein  31.13 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0134  hypothetical protein  28.57 
 
 
166 aa  53.9  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14952  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0574  hypothetical protein  34.26 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0411  hypothetical protein  46.94 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>