54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1246 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1246  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  264  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2108  hypothetical protein  54.17 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0149  hypothetical protein  57.02 
 
 		 123 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4353  hypothetical protein  56.41 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4372  hypothetical protein  52.94 
 
 		 125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000174807 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4311  hypothetical protein  52.1 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3252  hypothetical protein  47.11 
 
 		 147 aa  117  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  hitchhiker  3.08199e-16 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1242  hypothetical protein  47.9 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0167  hypothetical protein  53.54 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2581  hypothetical protein  48.33 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1634  hypothetical protein  47.5 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1375  hypothetical protein  47.06 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3619  hypothetical protein  48.33 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2357  hypothetical protein  44.44 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0657686  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2386  hypothetical protein  47.5 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2876  hypothetical protein  45.83 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.585701  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1333  hypothetical protein  44.07 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879036  normal  0.042363 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1499  hypothetical protein  54.08 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00140337  hitchhiker  0.0000264658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0943  hypothetical protein  43.8 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1620  hypothetical protein  45.24 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0805096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1051  hypothetical protein  41.8 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0081  hypothetical protein  37.5 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0902  hypothetical protein  43.97 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000090715  hitchhiker  0.00000319035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1481  hypothetical protein  37.39 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0238  hypothetical protein  41.51 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.973581  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0976  hypothetical protein  34.71 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216139  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0574  hypothetical protein  41.54 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0465  hypothetical protein  40.74 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2929  hypothetical protein  30.58 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.20874  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2551  hypothetical protein  36.29 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.311981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0879  hypothetical protein  38.24 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374693  hitchhiker  0.0000252652 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1435  hypothetical protein  34.43 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2927  hypothetical protein  37.5 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0868  hypothetical protein  36.28 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4808  hypothetical protein  35.09 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1694  hypothetical protein  34.86 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2464  hypothetical protein  31.67 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1849  hypothetical protein  33.02 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0701  hypothetical protein  32.41 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.580234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3030  hypothetical protein  36.54 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0072  hypothetical protein  32.38 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.0725128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2568  hypothetical protein  32.81 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.995822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1141  hypothetical protein  34.58 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1568  hypothetical protein  34.58 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214101  normal  0.171245 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1033  hypothetical protein  31.37 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0855  GTP-binding signal recognition particle  34 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.471576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1195  hypothetical protein  34 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.350794  normal  0.0471945 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1610  hypothetical protein  34 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00644955  normal  0.0278049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6543  hypothetical protein  32.32 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2540  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-domain  30.1 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0134  hypothetical protein  32.28 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14952  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1210  hypothetical protein  29.13 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0411  hypothetical protein  43.75 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3085  hypothetical protein  37.5 
 
 		 48 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>