54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1210 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1210  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  283  7e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2551  hypothetical protein  47.54 
 
 
133 aa  122  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.311981  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2929  hypothetical protein  48.76 
 
 
127 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.20874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2464  hypothetical protein  50.41 
 
 
135 aa  121  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0072  hypothetical protein  48.36 
 
 
134 aa  119  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.0725128 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0868  hypothetical protein  45.45 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1481  hypothetical protein  44.83 
 
 
144 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0855  GTP-binding signal recognition particle  43.8 
 
 
145 aa  104  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.471576  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1610  hypothetical protein  43.8 
 
 
151 aa  103  9e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00644955  normal  0.0278049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0879  hypothetical protein  39.52 
 
 
133 aa  100  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374693  hitchhiker  0.0000252652 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1195  hypothetical protein  42.02 
 
 
145 aa  98.6  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.350794  normal  0.0471945 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2540  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-domain  40.83 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0976  hypothetical protein  43.86 
 
 
130 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216139  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1033  hypothetical protein  37.19 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1849  hypothetical protein  39.09 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2927  hypothetical protein  34.23 
 
 
148 aa  76.6  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1694  hypothetical protein  35.59 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1634  hypothetical protein  37.62 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4808  hypothetical protein  38.61 
 
 
132 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754824 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2568  hypothetical protein  35.65 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.995822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1141  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2108  hypothetical protein  34.17 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4353  hypothetical protein  36.52 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2581  hypothetical protein  36.54 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0465  hypothetical protein  32.38 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4372  hypothetical protein  34.31 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000174807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0238  hypothetical protein  32.5 
 
 
129 aa  67  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.973581  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3030  hypothetical protein  33.93 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0574  hypothetical protein  39.67 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0081  hypothetical protein  30.7 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4311  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6543  hypothetical protein  36.19 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0902  hypothetical protein  34.95 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000090715  hitchhiker  0.00000319035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1333  hypothetical protein  31 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879036  normal  0.042363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2876  hypothetical protein  28.69 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.585701  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0701  hypothetical protein  31.9 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.580234  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1435  hypothetical protein  32.48 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1568  hypothetical protein  28.93 
 
 
124 aa  59.3  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214101  normal  0.171245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1242  hypothetical protein  29.51 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0149  hypothetical protein  34.21 
 
 
123 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2357  hypothetical protein  27.27 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0657686  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0167  hypothetical protein  34.34 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1051  hypothetical protein  33.06 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3619  hypothetical protein  32.41 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1375  hypothetical protein  30.51 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3252  hypothetical protein  32.74 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  hitchhiker  3.08199e-16 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2386  hypothetical protein  35.05 
 
 
130 aa  50.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0411  hypothetical protein  39.66 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0943  hypothetical protein  29.52 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3085  hypothetical protein  43.48 
 
 
48 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1246  hypothetical protein  28.57 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1499  hypothetical protein  32.61 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00140337  hitchhiker  0.0000264658 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0134  hypothetical protein  28.83 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14952  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1620  hypothetical protein  31.43 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0805096  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>