53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2927 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2927  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  302  9.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0902  hypothetical protein  63.87 
 
 
129 aa  156  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000090715  hitchhiker  0.00000319035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0238  hypothetical protein  57.98 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.973581  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3030  hypothetical protein  55.56 
 
 
140 aa  131  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1435  hypothetical protein  43.31 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0465  hypothetical protein  52.25 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1141  hypothetical protein  49.54 
 
 
133 aa  104  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1694  hypothetical protein  44.44 
 
 
122 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0976  hypothetical protein  48.28 
 
 
130 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216139  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2108  hypothetical protein  44.76 
 
 
128 aa  98.2  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2568  hypothetical protein  39.52 
 
 
136 aa  91.3  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.995822 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0701  hypothetical protein  39.83 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.580234  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1610  hypothetical protein  41.8 
 
 
151 aa  89  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00644955  normal  0.0278049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4353  hypothetical protein  46.15 
 
 
127 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0855  GTP-binding signal recognition particle  40.16 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.471576  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1195  hypothetical protein  43.36 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.350794  normal  0.0471945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1634  hypothetical protein  38.39 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4372  hypothetical protein  41.28 
 
 
125 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000174807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4808  hypothetical protein  37.5 
 
 
132 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754824 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2581  hypothetical protein  38.39 
 
 
125 aa  84  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4311  hypothetical protein  40.37 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3252  hypothetical protein  34.81 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  hitchhiker  3.08199e-16 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1033  hypothetical protein  36.07 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1481  hypothetical protein  43.27 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0868  hypothetical protein  41.96 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2464  hypothetical protein  36.29 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2551  hypothetical protein  38.24 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.311981  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3619  hypothetical protein  41.58 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1242  hypothetical protein  42.48 
 
 
135 aa  77  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1210  hypothetical protein  34.23 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1568  hypothetical protein  37.04 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214101  normal  0.171245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0072  hypothetical protein  33.61 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.0725128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1375  hypothetical protein  40.57 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2929  hypothetical protein  37.27 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.20874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0149  hypothetical protein  40.95 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1333  hypothetical protein  38.46 
 
 
128 aa  72  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879036  normal  0.042363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0879  hypothetical protein  40.35 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374693  hitchhiker  0.0000252652 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2540  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-domain  36.94 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0943  hypothetical protein  43.3 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0167  hypothetical protein  37.86 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2386  hypothetical protein  36.97 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2876  hypothetical protein  37.14 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.585701  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1246  hypothetical protein  37.5 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0081  hypothetical protein  36.28 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6543  hypothetical protein  39.78 
 
 
114 aa  62.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1051  hypothetical protein  38.71 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2357  hypothetical protein  33.04 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0657686  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1499  hypothetical protein  40.66 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00140337  hitchhiker  0.0000264658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1849  hypothetical protein  29.81 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1620  hypothetical protein  33.02 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0805096  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0574  hypothetical protein  45.31 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476606  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0134  hypothetical protein  26.87 
 
 
166 aa  44.3  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3086  hypothetical protein  40.38 
 
 
53 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>