24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0345 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0345  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  468  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0106  hypothetical protein  74.21 
 
 		 240 aa  328  6e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2507  hypothetical protein  31.82 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1651  hypothetical protein  30.66 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.406085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1026  hypothetical protein  30.7 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0973529 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2329  hypothetical protein  34.46 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.624273 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0920  hypothetical protein  28.84 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.143671  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1034  hypothetical protein  31.86 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0363723 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02510  hypothetical protein  27.87 
 
 		 390 aa  67  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.014465 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1376  hypothetical protein  28.97 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0018  hypothetical protein  26.37 
 
 		 471 aa  57  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000421814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1026  hypothetical protein  29.11 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0861894  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2353  hypothetical protein  27.95 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.322402 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04900  hypothetical protein  29.35 
 
 		 401 aa  49.7  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.216229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4098  hypothetical protein  38.57 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2354  hypothetical protein  30.72 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1982  hypothetical protein  34.48 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.14566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0346  hypothetical protein  27.27 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1065  hypothetical protein  24.59 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.465005  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0351  hypothetical protein  28.05 
 
 		 192 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0001765  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1204  hypothetical protein  28.5 
 
 		 234 aa  42.4  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00740593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2508  hypothetical protein  27.45 
 
 		 241 aa  42  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0915  hypothetical protein  27.7 
 
 		 277 aa  42  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0107  hypothetical protein  26.52 
 
 		 242 aa  41.6  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.538941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>