25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0018 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0018  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  882    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000421814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02510  hypothetical protein  27.78 
 
 		 390 aa  95.9  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.014465 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  41.22 
 
 		 2397 aa  93.6  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2329  hypothetical protein  28.19 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.624273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2032  ribonuclease  44.37 
 
 		 1142 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.390229  normal  0.144876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8097  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like protein  31.72 
 
 		 521 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  34.07 
 
 		 3409 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26100  predicted protein  33.33 
 
 		 1646 aa  63.5  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.490738  normal  0.061037 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04900  hypothetical protein  24.81 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.216229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3121  mucin 17-like protein  48.28 
 
 		 1788 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2836  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 583 aa  53.5  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00147111  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  25.47 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  35.25 
 
 		 1049 aa  50.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2507  hypothetical protein  32.35 
 
 		 220 aa  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4228  hypothetical protein  38.46 
 
 		 653 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0345  hypothetical protein  26.24 
 
 		 239 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  30.06 
 
 		 1101 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 356 aa  48.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  27.1 
 
 		 991 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  47.14 
 
 		 793 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  43.28 
 
 		 970 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35840  hypothetical protein  41.94 
 
 		 606 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15555  predicted protein  37.04 
 
 		 1706 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0352  Peptidase S53 propeptide  33.33 
 
 		 910 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.065042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>