29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1651 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1651  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  401  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.406085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1026  hypothetical protein  76.67 
 
 
212 aa  309  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0973529 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0920  hypothetical protein  72.86 
 
 
212 aa  261  6e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.143671  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1026  hypothetical protein  49.52 
 
 
211 aa  171  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0861894  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0345  hypothetical protein  32.09 
 
 
239 aa  102  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0106  hypothetical protein  28.04 
 
 
240 aa  92  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39004  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1034  hypothetical protein  30.23 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0363723 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2353  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  85.5  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.322402 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0351  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0001765  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1376  hypothetical protein  27.05 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2354  hypothetical protein  31.87 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2926  hypothetical protein  26.14 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2507  hypothetical protein  24.53 
 
 
220 aa  58.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0946  hypothetical protein  33.06 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0259376  normal  0.453278 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1982  hypothetical protein  26.47 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.14566 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0852  hypothetical protein  27.88 
 
 
292 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.859485  normal  0.0277307 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0915  hypothetical protein  28.65 
 
 
277 aa  50.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1250  hypothetical protein  27.23 
 
 
264 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.093421  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2329  hypothetical protein  25.36 
 
 
310 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.624273 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1672  hypothetical protein  29.59 
 
 
273 aa  45.8  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0945  hypothetical protein  31.34 
 
 
227 aa  45.8  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0846267  normal  0.177329 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1804  hypothetical protein  29.29 
 
 
289 aa  45.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0147432  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4098  hypothetical protein  28.04 
 
 
251 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1114  hypothetical protein  26.64 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1065  hypothetical protein  25.6 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.465005  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0851  hypothetical protein  26.95 
 
 
289 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.117075  normal  0.0153246 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1066  hypothetical protein  23.91 
 
 
293 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.789308  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1067  hypothetical protein  29.73 
 
 
153 aa  42  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.361676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2969  CzcA family heavy metal efflux protein  38.16 
 
 
1054 aa  41.6  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>