24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0920 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0920  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.143671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1026  hypothetical protein  87.74 
 
 
212 aa  357  6e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0973529 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1651  hypothetical protein  72.86 
 
 
210 aa  277  9e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.406085  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1026  hypothetical protein  49.06 
 
 
211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0861894  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1034  hypothetical protein  31.16 
 
 
235 aa  92.8  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0363723 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0106  hypothetical protein  27.23 
 
 
240 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39004  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0345  hypothetical protein  29.77 
 
 
239 aa  84.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2353  hypothetical protein  36.32 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.322402 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1376  hypothetical protein  30 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0351  hypothetical protein  38.82 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0001765  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2926  hypothetical protein  25 
 
 
232 aa  64.7  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2354  hypothetical protein  30.86 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2507  hypothetical protein  25.23 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2329  hypothetical protein  26.96 
 
 
310 aa  55.5  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.624273 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1065  hypothetical protein  30.82 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.465005  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4098  hypothetical protein  30.84 
 
 
251 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0945  hypothetical protein  29.13 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0846267  normal  0.177329 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1250  hypothetical protein  29.38 
 
 
264 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.093421  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1982  hypothetical protein  26.22 
 
 
240 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.14566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0107  hypothetical protein  24.77 
 
 
242 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.538941  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1068  hypothetical protein  26.09 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.470708  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0852  hypothetical protein  22.67 
 
 
292 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.859485  normal  0.0277307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0346  hypothetical protein  24.3 
 
 
241 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1672  hypothetical protein  25.15 
 
 
273 aa  42  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>