25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2354 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2354  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  412  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2353  hypothetical protein  85.78 
 
 
223 aa  367  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.322402 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1065  hypothetical protein  46.58 
 
 
213 aa  185  5e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.465005  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1068  hypothetical protein  38.74 
 
 
225 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.470708  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1064  hypothetical protein  37.33 
 
 
232 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.766585  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1204  hypothetical protein  37.89 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00740593 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0764  hypothetical protein  36.53 
 
 
218 aa  122  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.649157  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1632  hypothetical protein  37.95 
 
 
221 aa  111  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.347458 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1250  hypothetical protein  33.48 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.093421  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2177  hypothetical protein  37.02 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.989827  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1067  hypothetical protein  41.06 
 
 
153 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.361676  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0945  hypothetical protein  33.78 
 
 
227 aa  94  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0846267  normal  0.177329 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1651  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  85.5  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.406085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1026  hypothetical protein  33.66 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0973529 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0912  hypothetical protein  29.54 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0946  hypothetical protein  32.58 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0259376  normal  0.453278 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0115  hypothetical protein  29.67 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0920  hypothetical protein  30.99 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.143671  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0345  hypothetical protein  30.52 
 
 
239 aa  55.1  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1026  hypothetical protein  29.61 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0861894  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2926  hypothetical protein  33.33 
 
 
232 aa  52.4  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0106  hypothetical protein  25 
 
 
240 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39004  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2507  hypothetical protein  25.82 
 
 
220 aa  45.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1798  hypothetical protein  32.87 
 
 
219 aa  45.4  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1982  hypothetical protein  33.64 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.14566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>