18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1065 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1065  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.465005  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2353  hypothetical protein  48.66 
 
 
223 aa  201  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.322402 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1068  hypothetical protein  42.54 
 
 
225 aa  185  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.470708  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2354  hypothetical protein  46.58 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0764  hypothetical protein  39.07 
 
 
218 aa  150  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.649157  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1064  hypothetical protein  38.16 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.766585  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1632  hypothetical protein  50 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.347458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1204  hypothetical protein  37.44 
 
 
234 aa  122  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00740593 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1067  hypothetical protein  51.38 
 
 
153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.361676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1250  hypothetical protein  33.19 
 
 
264 aa  106  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.093421  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2177  hypothetical protein  27.84 
 
 
286 aa  99  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.989827  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0945  hypothetical protein  27.07 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0846267  normal  0.177329 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0946  hypothetical protein  33.64 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0259376  normal  0.453278 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1026  hypothetical protein  29.35 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0973529 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0115  hypothetical protein  29.83 
 
 
272 aa  56.6  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0912  hypothetical protein  25.88 
 
 
302 aa  56.6  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2926  hypothetical protein  31.25 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0345  hypothetical protein  24.59 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>