25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2353 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2353  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  426  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.322402 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2354  hypothetical protein  85.78 
 
 
218 aa  333  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1065  hypothetical protein  48.66 
 
 
213 aa  201  6e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.465005  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1068  hypothetical protein  40.95 
 
 
225 aa  160  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.470708  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1064  hypothetical protein  40 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.766585  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1204  hypothetical protein  40.52 
 
 
234 aa  150  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00740593 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0764  hypothetical protein  39.73 
 
 
218 aa  141  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.649157  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2177  hypothetical protein  32.69 
 
 
286 aa  117  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.989827  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1067  hypothetical protein  46.36 
 
 
153 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.361676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1632  hypothetical protein  37.55 
 
 
221 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.347458 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1250  hypothetical protein  32.03 
 
 
264 aa  108  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.093421  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0945  hypothetical protein  32.89 
 
 
227 aa  98.2  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0846267  normal  0.177329 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1026  hypothetical protein  36.32 
 
 
212 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0973529 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1651  hypothetical protein  34.83 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.406085  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0946  hypothetical protein  35.91 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0259376  normal  0.453278 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0912  hypothetical protein  27.59 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0115  hypothetical protein  28.02 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0920  hypothetical protein  33.92 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.143671  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1026  hypothetical protein  29.61 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0861894  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1798  hypothetical protein  32.56 
 
 
219 aa  52  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0345  hypothetical protein  28.3 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2926  hypothetical protein  30.51 
 
 
232 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0106  hypothetical protein  24.69 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39004  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1982  hypothetical protein  36.67 
 
 
240 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.14566 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1034  hypothetical protein  24.86 
 
 
235 aa  45.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0363723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>