21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0106 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0106  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0345  hypothetical protein  74.21 
 
 		 239 aa  328  4e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2507  hypothetical protein  34.84 
 
 		 220 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1026  hypothetical protein  27.7 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0973529 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1651  hypothetical protein  27.57 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.406085  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0920  hypothetical protein  28.17 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.143671  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1026  hypothetical protein  27.65 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0861894  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1376  hypothetical protein  31.4 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1034  hypothetical protein  30.73 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0363723 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02510  hypothetical protein  25.14 
 
 		 390 aa  54.7  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.014465 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2329  hypothetical protein  28.8 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.624273 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2353  hypothetical protein  24.69 
 
 		 223 aa  49.7  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.322402 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2354  hypothetical protein  25 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0018  hypothetical protein  23.92 
 
 		 471 aa  47.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000421814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1982  hypothetical protein  32.69 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.14566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0351  hypothetical protein  29.07 
 
 		 192 aa  45.4  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0001765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4098  hypothetical protein  35.44 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1204  hypothetical protein  29.91 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00740593 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04900  hypothetical protein  25.5 
 
 		 401 aa  42.4  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.216229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0346  hypothetical protein  28.33 
 
 		 241 aa  42  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2926  hypothetical protein  26.96 
 
 		 232 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>