16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1376 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1376  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1427  hypothetical protein  32.35 
 
 
245 aa  98.6  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1034  hypothetical protein  32.27 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0363723 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2926  hypothetical protein  36.14 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1982  hypothetical protein  35.44 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.14566 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1026  hypothetical protein  28.11 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0973529 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0920  hypothetical protein  29.56 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.143671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0106  hypothetical protein  31.4 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39004  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0345  hypothetical protein  28.97 
 
 
239 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1651  hypothetical protein  25.12 
 
 
210 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.406085  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1026  hypothetical protein  29.22 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0861894  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0351  hypothetical protein  29.63 
 
 
192 aa  49.3  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0001765  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1250  hypothetical protein  25.93 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.093421  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1825  hypothetical protein  27.27 
 
 
219 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1123  hypothetical protein  32.41 
 
 
318 aa  45.4  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1672  hypothetical protein  25.12 
 
 
273 aa  42  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>