28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3105 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3105  putative general secretion pathway related transmembrane protein  100 
 
 		 228 aa  437  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79717  normal  0.98729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3043  putative general secretion pathway related transmembrane protein  75.11 
 
 		 227 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.429926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3390  putative general secretion pathway related transmembrane protein  69.3 
 
 		 227 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3218  hypothetical protein  65.03 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3381  hypothetical protein  64.29 
 
 		 204 aa  158  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4498  putative general secretory pathway protein C  46.46 
 
 		 140 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.133212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3939  putative general secretory pathway protein C  45.67 
 
 		 140 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0059  hypothetical protein  40.31 
 
 		 136 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0011  hypothetical protein  40.31 
 
 		 136 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0010  general secretion pathway protein C  41.09 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2783  general secretion pathway protein C  41.09 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0223  GspC  41.09 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850985  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2665  general secretion pathway protein C  41.09 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0010  GspC  41.86 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0010  general secretion pathway protein C  41.09 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1887  general secretion pathway protein C  41.09 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.730387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3515  general secretion pathway protein C  41.09 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0049  general secretion pathway protein C  38.76 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454971  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0060  hypothetical protein  42.64 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3073  putative general secretory pathway protein C  36.72 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408549 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0078  hypothetical protein  39.53 
 
 		 136 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3241  hypothetical protein  39.53 
 
 		 136 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0059  general secretion pathway protein C  39.53 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1072  hypothetical protein  37.21 
 
 		 148 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904163  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1901  putative general secretion pathway related transmembrane protein  39.68 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55510  hypothetical protein  41.67 
 
 		 143 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.020808 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0314  type II secretion system protein C  28.35 
 
 		 288 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4831  hypothetical protein  44.07 
 
 		 143 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>