26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0059 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0059  general secretion pathway protein C  100 
 
 		 136 aa  267  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0049  general secretion pathway protein C  99.26 
 
 		 136 aa  265  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454971  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0010  GspC  80.88 
 
 		 136 aa  225  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2783  general secretion pathway protein C  81.62 
 
 		 136 aa  224  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2665  general secretion pathway protein C  81.62 
 
 		 136 aa  224  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0010  general secretion pathway protein C  81.62 
 
 		 136 aa  224  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0010  general secretion pathway protein C  81.62 
 
 		 136 aa  224  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1887  general secretion pathway protein C  81.62 
 
 		 136 aa  224  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.730387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3515  general secretion pathway protein C  81.62 
 
 		 136 aa  224  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0223  GspC  81.62 
 
 		 136 aa  224  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850985  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0011  hypothetical protein  92.65 
 
 		 136 aa  223  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0059  hypothetical protein  92.65 
 
 		 136 aa  223  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0078  hypothetical protein  94.12 
 
 		 136 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3241  hypothetical protein  91.91 
 
 		 136 aa  197  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0060  hypothetical protein  89.71 
 
 		 136 aa  197  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3939  putative general secretory pathway protein C  63.5 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4498  putative general secretory pathway protein C  65.69 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.133212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3073  putative general secretory pathway protein C  59.12 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408549 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3043  putative general secretion pathway related transmembrane protein  46.27 
 
 		 227 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.429926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3390  putative general secretion pathway related transmembrane protein  46.27 
 
 		 227 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3381  hypothetical protein  41.67 
 
 		 204 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3218  hypothetical protein  42.97 
 
 		 229 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1072  hypothetical protein  48.31 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904163  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3105  putative general secretion pathway related transmembrane protein  40.91 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79717  normal  0.98729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3194  putative general secretion pathway protein C  30.3 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.122783  hitchhiker  0.00278841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4163  hypothetical protein  36.92 
 
 		 177 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.962185  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>