27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3073 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_3073  putative general secretory pathway protein C  100 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4498  putative general secretory pathway protein C  78.57 
 
 		 140 aa  214  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.133212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3939  putative general secretory pathway protein C  75 
 
 		 140 aa  207  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0010  GspC  68.61 
 
 		 136 aa  191  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2783  general secretion pathway protein C  67.88 
 
 		 136 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2665  general secretion pathway protein C  67.88 
 
 		 136 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0223  GspC  67.88 
 
 		 136 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850985  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0010  general secretion pathway protein C  67.88 
 
 		 136 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0010  general secretion pathway protein C  67.88 
 
 		 136 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1887  general secretion pathway protein C  67.88 
 
 		 136 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.730387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3515  general secretion pathway protein C  67.88 
 
 		 136 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0011  hypothetical protein  63.5 
 
 		 136 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0059  hypothetical protein  63.5 
 
 		 136 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157484  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0049  general secretion pathway protein C  64.23 
 
 		 136 aa  155  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454971  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0060  hypothetical protein  62.04 
 
 		 136 aa  139  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0078  hypothetical protein  62.77 
 
 		 136 aa  139  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0059  general secretion pathway protein C  63.5 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3241  hypothetical protein  62.77 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3381  hypothetical protein  39.69 
 
 		 204 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3390  putative general secretion pathway related transmembrane protein  41.61 
 
 		 227 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3043  putative general secretion pathway related transmembrane protein  41.48 
 
 		 227 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.429926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3218  hypothetical protein  37.6 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1072  hypothetical protein  48.31 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904163  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3105  putative general secretion pathway related transmembrane protein  39.06 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79717  normal  0.98729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55510  hypothetical protein  27.64 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.020808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1320  hypothetical protein  32.28 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3194  putative general secretion pathway protein C  35.48 
 
 		 143 aa  40  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.122783  hitchhiker  0.00278841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>