26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3390 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3390  putative general secretion pathway related transmembrane protein  100 
 
 		 227 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3043  putative general secretion pathway related transmembrane protein  95.59 
 
 		 227 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.429926  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3105  putative general secretion pathway related transmembrane protein  69.87 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79717  normal  0.98729 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3218  hypothetical protein  61.71 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3381  hypothetical protein  62.7 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3939  putative general secretory pathway protein C  49.25 
 
 		 140 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4498  putative general secretory pathway protein C  48.51 
 
 		 140 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.133212 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2783  general secretion pathway protein C  47.01 
 
 		 136 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2665  general secretion pathway protein C  47.01 
 
 		 136 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0010  general secretion pathway protein C  47.01 
 
 		 136 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0010  general secretion pathway protein C  47.01 
 
 		 136 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1887  general secretion pathway protein C  47.01 
 
 		 136 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.730387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3515  general secretion pathway protein C  47.01 
 
 		 136 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0223  GspC  47.01 
 
 		 136 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850985  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0010  GspC  48.48 
 
 		 136 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0059  hypothetical protein  44.78 
 
 		 136 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0011  hypothetical protein  44.78 
 
 		 136 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0049  general secretion pathway protein C  43.7 
 
 		 136 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454971  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3073  putative general secretory pathway protein C  40 
 
 		 140 aa  84.7  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0060  hypothetical protein  45.52 
 
 		 136 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0078  hypothetical protein  44.03 
 
 		 136 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3241  hypothetical protein  42.54 
 
 		 136 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0059  general secretion pathway protein C  42.22 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1072  hypothetical protein  38.82 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904163  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1901  putative general secretion pathway related transmembrane protein  33.71 
 
 		 176 aa  52  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1348  hypothetical protein  31.33 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.671423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>