27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3381 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3381  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  390  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3218  hypothetical protein  69.79 
 
 		 229 aa  228  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3043  putative general secretion pathway related transmembrane protein  57.23 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.429926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3390  putative general secretion pathway related transmembrane protein  62.7 
 
 		 227 aa  154  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3105  putative general secretion pathway related transmembrane protein  63.96 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79717  normal  0.98729 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0010  GspC  44.7 
 
 		 136 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2783  general secretion pathway protein C  43.94 
 
 		 136 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2665  general secretion pathway protein C  43.94 
 
 		 136 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0010  general secretion pathway protein C  43.94 
 
 		 136 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0010  general secretion pathway protein C  43.94 
 
 		 136 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1887  general secretion pathway protein C  43.94 
 
 		 136 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.730387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3515  general secretion pathway protein C  43.94 
 
 		 136 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0223  GspC  43.94 
 
 		 136 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850985  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4498  putative general secretory pathway protein C  44.44 
 
 		 140 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.133212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3939  putative general secretory pathway protein C  41.27 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0059  hypothetical protein  41.67 
 
 		 136 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157484  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0049  general secretion pathway protein C  40.15 
 
 		 136 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454971  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0011  hypothetical protein  41.67 
 
 		 136 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0060  hypothetical protein  40.91 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3073  putative general secretory pathway protein C  38.93 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408549 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3241  hypothetical protein  39.39 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0078  hypothetical protein  38.64 
 
 		 136 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0059  general secretion pathway protein C  38.35 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1072  hypothetical protein  36.26 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904163  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1901  putative general secretion pathway related transmembrane protein  31.54 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55510  hypothetical protein  34.45 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.020808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3418  general secretion pathway protein C  25.83 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000246918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>