More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7375 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007489  RSP_7375  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  100 
 
 
184 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4965  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  50.28 
 
 
192 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0251  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  48.35 
 
 
188 aa  178  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2591  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  46.2 
 
 
212 aa  164  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.212663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3909  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  43.82 
 
 
184 aa  154  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19089  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3435  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  46.47 
 
 
201 aa  148  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.248973  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13761  hypothetical protein  46.79 
 
 
183 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05770  hypothetical protein  44.3 
 
 
197 aa  145  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1453  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  44.38 
 
 
197 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2374  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  39.66 
 
 
188 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.962676  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1424  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  44.38 
 
 
197 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4533  hexapaptide repeat-containing transferase  43.26 
 
 
187 aa  141  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1176  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  42.39 
 
 
199 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1829  acetyltransferase-like protein  42.68 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0122431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3876  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  42.47 
 
 
187 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0327816  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0907  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  41.67 
 
 
180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00617955  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2235  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  42.78 
 
 
184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.778801  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2336  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  42.78 
 
 
184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.556666 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2450  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  42.78 
 
 
184 aa  131  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal  0.0117198 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2292  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  42.78 
 
 
184 aa  131  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.611574  normal  0.020908 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2343  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  42.78 
 
 
184 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1008  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  41.81 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01960  predicted acyl transferase  41.24 
 
 
182 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1603  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.24 
 
 
182 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.501226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1587  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  41.24 
 
 
182 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2347  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  41.24 
 
 
182 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1178  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  41.24 
 
 
182 aa  127  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01949  hypothetical protein  41.24 
 
 
182 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2989  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  41.24 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2668  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  39.55 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.104139 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2602  acetyltransferase-like protein  40.96 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1078  putative acetyltransferase  41.77 
 
 
187 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520725  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02945  putative acetyltransferase  39.31 
 
 
186 aa  123  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2092  transferase hexapeptide repeat containing protein  40 
 
 
179 aa  121  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6296  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.24 
 
 
184 aa  119  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.18335 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2466  acetyltransferase  41.48 
 
 
237 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.69192  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0826  hypothetical protein  40.91 
 
 
206 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3858  hypothetical protein  44.3 
 
 
206 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5855  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  38.07 
 
 
206 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.36358  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0562  putative acetyltransferase  38.89 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0007487  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2547  putative acetyltransferase  37.65 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3182  putative acetyltransferase  37.04 
 
 
185 aa  110  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.621032  hitchhiker  0.00169424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0688  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  40.79 
 
 
201 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3376  acetyltransferase  38 
 
 
208 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2752  hexapaptide repeat-containing transferase  38.41 
 
 
192 aa  96.7  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.733742  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0424  acetyltransferase  38.24 
 
 
204 aa  95.9  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.732254  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0131  acetyltransferase  36.36 
 
 
205 aa  84.3  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1480  acetyltransferase  34.86 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000385  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  29.87 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4918  hexapaptide repeat-containing transferase  27.44 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4281  acetyltransferase  30.97 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3469  galactoside-O-acetyltransferase  32.16 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303917  decreased coverage  0.000594115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3310  hexapaptide repeat-containing transferase  32.14 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.342326  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4862  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.2 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290079  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3538  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  31.58 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4278  acetyltransferase  31.76 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298738  hitchhiker  0.0000105124 
 
 
-
 
NC_003296  RS02346  putative acyl transferase protein  31.72 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.876426  normal  0.444308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1961  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  29.38 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.11607  hitchhiker  0.0000808015 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1099  putative acyltransferase in colanic acid biosynthesis  32.82 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0384  Maltose O-acetyltransferase  29.71 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00312808  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00296  galactoside O-acetyltransferase  29.55 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0465  maltose O-acetyltransferase  26.62 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0760174  hitchhiker  0.0000000000353002 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3264  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.55 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3283  galactoside O-acetyltransferase  29.55 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142249  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0415  galactoside O-acetyltransferase  29.55 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00300  hypothetical protein  29.55 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.279411  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003640  galactoside O-acetyltransferase  31.97 
 
 
199 aa  67  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.693048  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0373  galactoside O-acetyltransferase  29.55 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4492  hexapaptide repeat-containing transferase  29.41 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4185  hexapaptide repeat-containing transferase  29.53 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1408  acetyltransferase  29.23 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0573867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4774  maltose O-acetyltransferase  29.41 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.789771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4253  Galactoside O-acetyltransferase  33.08 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00506408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4847  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  33.02 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2912  maltose transacetylase  26.24 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.231486  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2590  maltose transacetylase  26.24 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3345  hexapaptide repeat-containing transferase  38.32 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.972352  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1260  maltose O-acetyltransferase  28.78 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1396  maltose O-acetyltransferase  29.93 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000138737  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3583  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.95 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2566  transferase hexapeptide repeat containing protein  25 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  30 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  30 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3978  acetyltransferase  30.46 
 
 
202 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.680257 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000461  antibiotic acetyltransferase  37.74 
 
 
214 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2073  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.78 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0302  hexapaptide repeat-containing transferase  28.57 
 
 
188 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.145068 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0977  antibiotic acetyltransferase  39.62 
 
 
232 aa  63.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4905  hexapaptide repeat-containing transferase  29.69 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0399  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  27.14 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.345276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1672  acetyltransferase  29.55 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0046  hypothetical protein  33.82 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000164559  normal  0.0456795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5216  hexapaptide repeat-containing transferase  31.58 
 
 
188 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502922  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0322  antibiotic acetyltransferase  39.62 
 
 
215 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.799706 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3135  transferase hexapeptide repeat containing protein  26.9 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0314  galactoside O-acetyltransferase  30.83 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.169128  hitchhiker  0.000159689 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02207  hypothetical protein  29.38 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12060  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  31.82 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4039  maltose O-acetyltransferase  28.17 
 
 
191 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.184379 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1584  hexapaptide repeat-containing transferase  27.59 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>