More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3538 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3538  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  100 
 
 		 273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3310  hexapaptide repeat-containing transferase  96.34 
 
 		 273 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.342326  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4278  acetyltransferase  74.36 
 
 		 273 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298738  hitchhiker  0.0000105124 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0131  acetyltransferase  33.52 
 
 		 205 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1480  acetyltransferase  38.52 
 
 		 187 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2092  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.37 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6296  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.3 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.18335 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2547  putative acetyltransferase  28.65 
 
 		 185 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4281  acetyltransferase  34.81 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1099  putative acyltransferase in colanic acid biosynthesis  35.77 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3182  putative acetyltransferase  31.4 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.621032  hitchhiker  0.00169424 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1078  putative acetyltransferase  33.1 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1802  acetyltransferase  32.05 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3978  acetyltransferase  32.91 
 
 		 202 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680257 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4905  hexapaptide repeat-containing transferase  32.59 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7375  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  31.58 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0562  putative acetyltransferase  25.44 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0007487  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0688  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  27.57 
 
 		 201 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0977  antibiotic acetyltransferase  40 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4965  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  31.29 
 
 		 192 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1829  acetyltransferase-like protein  34.97 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0122431 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  39.09 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2668  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  29.5 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.104139 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000461  antibiotic acetyltransferase  37.5 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2235  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  30.5 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.778801  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2292  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  30.5 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.611574  normal  0.020908 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2450  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  30.5 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal  0.0117198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2336  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  30.5 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.556666 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2343  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  30.5 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03419  O-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11510)  35.29 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.156384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.64 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  33.64 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02945  putative acetyltransferase  27.67 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3345  hexapaptide repeat-containing transferase  36.04 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.972352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  36.36 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3680  acetyltransferase  37.17 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0322  antibiotic acetyltransferase  37 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.799706 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4361  chloramphenicol O-acetyltransferase  37.5 
 
 		 215 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1044  putative acetyltransferase  32.52 
 
 		 294 aa  62  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4157  Chloramphenicol O-acetyltransferase  37.5 
 
 		 215 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4229  chloramphenicol O-acetyltransferase  37.5 
 
 		 215 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01960  predicted acyl transferase  30.22 
 
 		 182 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1603  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.22 
 
 		 182 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.501226  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2347  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  30.22 
 
 		 182 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01949  hypothetical protein  30.22 
 
 		 182 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1178  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  30.22 
 
 		 182 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1587  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  30.22 
 
 		 182 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0048  hypothetical protein  33.62 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0046  hypothetical protein  32.76 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2880  chloramphenicol acetyltransferase  40 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1008  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  29.5 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2861  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2408  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.1 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3876  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  30 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1176  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  25.18 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2989  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  29.5 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2456  chloramphenicol acetyltransferase  40.91 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.58 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0867  arsenate reductase  32.29 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.784017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13761  hypothetical protein  29.93 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3909  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  28.77 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5557  hexapaptide repeat-containing transferase  39.09 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102322 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7339  transacetylase  31.35 
 
 		 545 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0206236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2543  acetyltransferase  34.75 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567485  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2590  hexapaptide repeat-containing transferase  36.36 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6294  acetyltransferase  30.88 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148142  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0424  acetyltransferase  24.31 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.732254  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0907  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  29.93 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00617955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2752  hexapaptide repeat-containing transferase  33.08 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0296384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2073  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.77 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1439  hexapaptide repeat-containing transferase  34.82 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3152  acetyltransferase  35.71 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4533  hexapaptide repeat-containing transferase  26.57 
 
 		 187 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3855  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  30.96 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3435  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  25.83 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.248973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1660  acetyltransferase  36.27 
 
 		 175 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3106  acetyltransferase  31.54 
 
 		 183 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.440449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2591  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  27.34 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.212663 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1354  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  29.17 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5855  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  28.45 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.36358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2883  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  27.91 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3376  acetyltransferase  26.97 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3242  hexapaptide repeat-containing transferase  34.82 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2517  hexapaptide repeat-containing transferase  35.71 
 
 		 209 aa  57  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.467085  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0815  hexapaptide repeat-containing transferase  28.79 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2618  hexapaptide repeat-containing transferase  31.82 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2303  hexapaptide repeat-containing transferase  39.09 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.025404  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0418  acetyltransferase  28.68 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.576199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1399  hexapaptide repeat-containing transferase  34.82 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.272877 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06836  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family (AFU_orthologue; AFUA_2G08430)  27.68 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02346  putative acyl transferase protein  28.67 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.876426  normal  0.444308 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2577  hexapaptide repeat-containing transferase  29.91 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2631  hexapaptide repeat-containing transferase  29.91 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.778978  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4144  hexapaptide repeat-containing transferase  27.49 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1576  hexapaptide repeat-containing transferase  29.22 
 
 		 179 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4862  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.57 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3858  hypothetical protein  29.32 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1346  hexapaptide repeat-containing transferase  33.93 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185286 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0595  hypothetical protein  31.06 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2691  galactoside O-acetyltransferase  33.07 
 
 		 178 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000193243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>