More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2374 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2374  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  100 
 
 
188 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.962676  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0251  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  47.17 
 
 
188 aa  161  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2591  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  43.48 
 
 
212 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.212663 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7375  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  39.66 
 
 
184 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4965  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  43.64 
 
 
192 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2336  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  40.34 
 
 
184 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.556666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2235  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  40.34 
 
 
184 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.778801  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2450  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  40.34 
 
 
184 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal  0.0117198 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2292  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  39.77 
 
 
184 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.611574  normal  0.020908 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2343  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  39.77 
 
 
184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2668  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  38.64 
 
 
182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.104139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3909  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  40.36 
 
 
184 aa  132  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19089  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2347  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  37.5 
 
 
182 aa  131  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1587  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  37.5 
 
 
182 aa  131  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1603  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.5 
 
 
182 aa  131  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.501226  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1178  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  37.5 
 
 
182 aa  131  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0907  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  37.35 
 
 
180 aa  131  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00617955  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2989  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  37.5 
 
 
182 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1008  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  36.93 
 
 
182 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01960  predicted acyl transferase  36.93 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01949  hypothetical protein  36.93 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1829  acetyltransferase-like protein  37.75 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0122431 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5855  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  38.61 
 
 
206 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.36358  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1176  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  33.33 
 
 
199 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05770  hypothetical protein  39.74 
 
 
197 aa  120  8e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02945  putative acetyltransferase  33.87 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3876  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  36.63 
 
 
187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0327816  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4533  hexapaptide repeat-containing transferase  35.47 
 
 
187 aa  118  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1453  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  33.92 
 
 
197 aa  117  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1424  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  33.92 
 
 
197 aa  117  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2466  acetyltransferase  37.2 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.69192  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3858  hypothetical protein  36.2 
 
 
206 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13761  hypothetical protein  42.86 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2547  putative acetyltransferase  37.04 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3435  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  35.26 
 
 
201 aa  114  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.248973  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2602  acetyltransferase-like protein  36.14 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0826  hypothetical protein  34.36 
 
 
206 aa  111  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0562  putative acetyltransferase  36.65 
 
 
183 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0007487  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2092  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.36 
 
 
179 aa  105  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6296  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.33 
 
 
184 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.18335 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3182  putative acetyltransferase  38.65 
 
 
185 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.621032  hitchhiker  0.00169424 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1078  putative acetyltransferase  35.15 
 
 
187 aa  95.5  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520725  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3376  acetyltransferase  31.33 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2752  hexapaptide repeat-containing transferase  32.61 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.733742  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2880  putative lipopolysaccharide biosynthesis O-acetyl transferase WbbJ  27.44 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0424  acetyltransferase  31.11 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.732254  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1880  acetyltransferase  27.43 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0688  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  26.99 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1802  acetyltransferase  32.82 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1408  acetyltransferase  31.43 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0573867  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000385  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  29.93 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1672  acetyltransferase  32.86 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  30.5 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560945  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0384  Maltose O-acetyltransferase  28.57 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00312808  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1731  galactoside O-acetyltransferase  29.8 
 
 
198 aa  67.8  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.142359  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0163  putative acetyl transferase  38.46 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2073  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.91 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02346  putative acyl transferase protein  29.11 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.876426  normal  0.444308 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2691  galactoside O-acetyltransferase  27.43 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000193243  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003640  galactoside O-acetyltransferase  28.1 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.693048  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3469  galactoside-O-acetyltransferase  30 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303917  decreased coverage  0.000594115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0131  acetyltransferase  29.46 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02281  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) protein  28.57 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3624  hexapaptide repeat-containing transferase  28.24 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0423  acetyltransferase  32.58 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2830  acetyltransferase  30.94 
 
 
176 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00579309  normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3590  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  30.94 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0046  hypothetical protein  34.48 
 
 
220 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0251  galactoside O-acetyltransferase  25.9 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0630032  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2631  hexapaptide repeat-containing transferase  31.62 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.778978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2197  putative sugar acetyltransferase  29.69 
 
 
220 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2577  hexapaptide repeat-containing transferase  31.62 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0415  galactoside O-acetyltransferase  26.32 
 
 
203 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3345  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.972352  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0123  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  29.38 
 
 
178 aa  63.2  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00296  galactoside O-acetyltransferase  26.32 
 
 
203 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21865  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2566  transferase hexapeptide repeat containing protein  24.16 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3264  transferase hexapeptide repeat containing protein  26.32 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3583  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.08 
 
 
193 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1480  acetyltransferase  33.33 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3135  transferase hexapeptide repeat containing protein  26.06 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3095  hexapaptide repeat-containing transferase  30.28 
 
 
239 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.165073 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3283  galactoside O-acetyltransferase  26.32 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142249  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00300  hypothetical protein  26.32 
 
 
203 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.279411  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12060  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  27.32 
 
 
193 aa  62.4  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0739  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.52 
 
 
200 aa  62  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.597159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3034  putative sugar acetyltransferase  29.19 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1850  maltose O-acetyltransferase  29.85 
 
 
215 aa  62  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1260  maltose O-acetyltransferase  30.34 
 
 
184 aa  61.6  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3032  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.75 
 
 
205 aa  61.6  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1660  acetyltransferase  30.6 
 
 
175 aa  62  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135233  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0048  hypothetical protein  32.41 
 
 
220 aa  61.6  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3168  hexapaptide repeat-containing transferase  25.81 
 
 
203 aa  61.2  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1486  isoleucine patch superfamily acetyltransferase-like protein  28.44 
 
 
278 aa  61.2  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1974  hypothetical protein  26.39 
 
 
187 aa  61.2  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.931779  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3855  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  33.33 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895064  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2893  acetyl transferase  35.96 
 
 
240 aa  60.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000824087  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2912  maltose transacetylase  23.78 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.231486  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2590  maltose transacetylase  23.78 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4918  hexapaptide repeat-containing transferase  28.89 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>