More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4278 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4278  acetyltransferase  100 
 
 		 273 aa  563  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298738  hitchhiker  0.0000105124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3310  hexapaptide repeat-containing transferase  75.46 
 
 		 273 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.342326  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3538  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  74.36 
 
 		 273 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1480  acetyltransferase  38.22 
 
 		 187 aa  98.2  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0131  acetyltransferase  35.37 
 
 		 205 aa  95.9  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6296  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.3 
 
 		 184 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.18335 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0562  putative acetyltransferase  28.49 
 
 		 183 aa  85.9  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0007487  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2547  putative acetyltransferase  31.07 
 
 		 185 aa  85.9  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1099  putative acyltransferase in colanic acid biosynthesis  37.23 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4281  acetyltransferase  37.78 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3978  acetyltransferase  36.25 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680257 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2092  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.17 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0688  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  29.73 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3182  putative acetyltransferase  31.98 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.621032  hitchhiker  0.00169424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3876  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  31.25 
 
 		 187 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1078  putative acetyltransferase  30.91 
 
 		 187 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4533  hexapaptide repeat-containing transferase  30.56 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4965  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  31.97 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1802  acetyltransferase  35.11 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2668  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  30.28 
 
 		 182 aa  72  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.104139 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2073  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.33 
 
 		 187 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1176  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  28.78 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7375  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  31.76 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3435  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  29.08 
 
 		 201 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.248973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02945  putative acetyltransferase  31.62 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0424  acetyltransferase  26.47 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.732254  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5855  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  25 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.36358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3345  hexapaptide repeat-containing transferase  40.57 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.972352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  37.25 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3376  acetyltransferase  28.57 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2450  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  30.5 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal  0.0117198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2336  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  30.5 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.556666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2235  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  30.5 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.778801  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01960  predicted acyl transferase  31.65 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01949  hypothetical protein  31.65 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2439  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  30.14 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1603  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.65 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.501226  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1178  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  31.65 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  38.24 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2347  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  31.65 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1587  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  31.65 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0826  hypothetical protein  31.69 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02346  putative acyl transferase protein  30.34 
 
 		 170 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.876426  normal  0.444308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1660  acetyltransferase  40.2 
 
 		 175 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2343  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  30.5 
 
 		 184 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1044  putative acetyltransferase  34.11 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6294  acetyltransferase  33.08 
 
 		 191 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.96 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2292  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  30.5 
 
 		 184 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.611574  normal  0.020908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  33.96 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0251  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  29.75 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3909  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  28.87 
 
 		 184 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000461  antibiotic acetyltransferase  37 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0048  hypothetical protein  39 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3858  hypothetical protein  30.99 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7339  transacetylase  31.05 
 
 		 545 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0206236  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2466  acetyltransferase  30.99 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.69192  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2880  chloramphenicol acetyltransferase  37.39 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2989  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  30.94 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4048  acetyltransferase  36.89 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.638 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4157  Chloramphenicol O-acetyltransferase  37 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0046  hypothetical protein  34.48 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2456  chloramphenicol acetyltransferase  38.26 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4361  chloramphenicol O-acetyltransferase  37 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4229  chloramphenicol O-acetyltransferase  37 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0513  maltose O-acetyltransferase  34.91 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000528215  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4299  chloramphenicol acetyltransferase  47.69 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0532  maltose O-acetyltransferase  34.91 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0502164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0522  maltose O-acetyltransferase  34.91 
 
 		 183 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00115683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5557  hexapaptide repeat-containing transferase  36.52 
 
 		 219 aa  62  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102322 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0575  maltose O-acetyltransferase  34.91 
 
 		 183 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00855967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0977  antibiotic acetyltransferase  36 
 
 		 232 aa  62  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4862  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.64 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290079  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.96 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0322  antibiotic acetyltransferase  40 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.799706 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4905  hexapaptide repeat-containing transferase  26.97 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13761  hypothetical protein  28.95 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1008  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  30.22 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1354  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  30.56 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0815  hexapaptide repeat-containing transferase  28.79 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000385  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  35.24 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0907  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  27.4 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00617955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2303  hexapaptide repeat-containing transferase  38.39 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.025404  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0516  maltose O-acetyltransferase  33.96 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000205896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0767  nodulation protein L  27.68 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.55437  hitchhiker  0.000000843349 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06836  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family (AFU_orthologue; AFUA_2G08430)  28.83 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1118  putative acetyltransferase  31.21 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1901  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.33 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0897  transferase family protein  31.21 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3377  maltose O-acetyltransferase  34.95 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3375  maltose O-acetyltransferase  34.95 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.567242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3155  maltose O-acetyltransferase  34.95 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000124616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3140  maltose O-acetyltransferase  34.95 
 
 		 187 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0964249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3402  maltose O-acetyltransferase  34.95 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00827475  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0867  arsenate reductase  27.93 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.784017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2968  acetyltransferase  29.41 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.11746  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2756  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  44.83 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.801902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2912  maltose transacetylase  31.53 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.231486  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2590  maltose transacetylase  31.53 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0939  maltose O-acetyltransferase  33.96 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>