15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4198 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4198    100 
 
 		 342 bp  678    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125947  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  88.66 
 
 		 846 bp  351  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  86.47 
 
 		 846 bp  266  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  85.84 
 
 		 846 bp  264  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  94.44 
 
 		 927 bp  56  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  94.29 
 
 		 816 bp  54  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  96.55 
 
 		 825 bp  50.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 834 bp  50.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3343    85.19 
 
 		 385 bp  50.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 840 bp  50.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  96.55 
 
 		 831 bp  50.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  96.55 
 
 		 816 bp  50.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  96.3 
 
 		 837 bp  46.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  82.67 
 
 		 855 bp  46.1  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  96.3 
 
 		 846 bp  46.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>