36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2474 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2474  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  332  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0542451  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1138  hypothetical protein  98.81 
 
 		 105 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.561282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1083  hypothetical protein  83.33 
 
 		 105 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0845642 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1139  hypothetical protein  98.48 
 
 		 66 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2893  hypothetical protein  70.24 
 
 		 105 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.597202  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1084  hypothetical protein  80.3 
 
 		 66 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0473834 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1066  hypothetical protein  58.33 
 
 		 107 aa  97.4  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.131086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2169  hypothetical protein  57.14 
 
 		 109 aa  95.5  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1640  hypothetical protein  59.77 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1641  hypothetical protein  53.97 
 
 		 74 aa  70.5  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1420  gene transfer agent (GTA) like protein  50 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0595  hypothetical protein  51.19 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1067  hypothetical protein  58.93 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.126814 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0596  hypothetical protein  51.19 
 
 		 111 aa  67  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1175  gene transfer agent (GTA) like protein  47.62 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.734376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1818  gene transfer agent (GTA) like protein  54.41 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.206813  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0913  hypothetical protein  46.51 
 
 		 105 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1698  gene transfer agent (GTA) orfg10  51.19 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0203645  normal  0.306867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1424  gene transfer agent (GTA) orfg10  51.19 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.151518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1984  gene transfer agent (GTA) orfg10  45.24 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3162  gene transfer agent (GTA) like protein  50 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0433156  normal  0.0131384 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3464  gene transfer agent (GTA) orfg10  44.05 
 
 		 104 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4973  gene transfer agent (GTA) orfg10  50 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.0000866578 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1346  hypothetical protein  43.3 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000547988  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1420  gene transfer agent (GTA) orfg10  50 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2111  hypothetical protein  47.54 
 
 		 67 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00358078  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2892  hypothetical protein  51.61 
 
 		 70 aa  51.2  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.35936  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1176  hypothetical protein  41.54 
 
 		 70 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.829742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1421  hypothetical protein  40.58 
 
 		 70 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1985  hypothetical protein  44.26 
 
 		 65 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767846  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3463  hypothetical protein  41.54 
 
 		 67 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0791609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2110  gene transfer agent (GTA) like protein  45.24 
 
 		 105 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000925586  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2168  hypothetical protein  62.3 
 
 		 71 aa  45.1  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1819  hypothetical protein  42.19 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1347  gene transfer agent (GTA) orfg10  44.44 
 
 		 62 aa  41.2  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000217924  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3909  hypothetical protein  46.97 
 
 		 102 aa  40.8  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.576255  normal  0.0625808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>