24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1698 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1698  gene transfer agent (GTA) orfg10  100 
 
 		 110 aa  206  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0203645  normal  0.306867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1424  gene transfer agent (GTA) orfg10  96.3 
 
 		 108 aa  192  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.151518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1420  gene transfer agent (GTA) orfg10  92.59 
 
 		 108 aa  183  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4973  gene transfer agent (GTA) orfg10  78.85 
 
 		 115 aa  148  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.0000866578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1984  gene transfer agent (GTA) orfg10  50 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1346  hypothetical protein  53 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000547988  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1420  gene transfer agent (GTA) like protein  52 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3464  gene transfer agent (GTA) orfg10  47.12 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1175  gene transfer agent (GTA) like protein  49.51 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.734376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1818  gene transfer agent (GTA) like protein  51 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.206813  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_004310  BR0595  hypothetical protein  47.52 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0596  hypothetical protein  46.53 
 
 		 111 aa  86.7  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0913  hypothetical protein  48.51 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909835 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1066  hypothetical protein  45.63 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.131086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2110  gene transfer agent (GTA) like protein  50.48 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000925586  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1083  hypothetical protein  53.57 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0845642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2169  hypothetical protein  47.62 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1138  hypothetical protein  57.97 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.561282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1640  hypothetical protein  48 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2474  hypothetical protein  57.35 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0542451  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2893  hypothetical protein  53.62 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.597202  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3162  gene transfer agent (GTA) like protein  41.59 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0433156  normal  0.0131384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3909  hypothetical protein  50.75 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.576255  normal  0.0625808 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0927  hypothetical protein  54.55 
 
 		 89 aa  50.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.398072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>