23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2893 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2893  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  195  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.597202  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1083  hypothetical protein  68.6 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0845642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2474  hypothetical protein  70.37 
 
 		 172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0542451  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1138  hypothetical protein  72.37 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.561282 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1066  hypothetical protein  58 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.131086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2169  hypothetical protein  56.98 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1640  hypothetical protein  54.46 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_004310  BR0595  hypothetical protein  42 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1818  gene transfer agent (GTA) like protein  45 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.206813  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0596  hypothetical protein  42 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3464  gene transfer agent (GTA) orfg10  43 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1420  gene transfer agent (GTA) like protein  44 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1984  gene transfer agent (GTA) orfg10  42 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0913  hypothetical protein  48.05 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4973  gene transfer agent (GTA) orfg10  48 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.0000866578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1424  gene transfer agent (GTA) orfg10  47 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.151518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1175  gene transfer agent (GTA) like protein  41 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.734376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1346  hypothetical protein  40.4 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000547988  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1698  gene transfer agent (GTA) orfg10  53.62 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0203645  normal  0.306867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3162  gene transfer agent (GTA) like protein  43.27 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0433156  normal  0.0131384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1420  gene transfer agent (GTA) orfg10  52.17 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2110  gene transfer agent (GTA) like protein  44 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000925586  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3909  hypothetical protein  47.76 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.576255  normal  0.0625808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>