14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0927 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0927  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  168  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.398072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3464  gene transfer agent (GTA) orfg10  44.44 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1420  gene transfer agent (GTA) orfg10  42.86 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1818  gene transfer agent (GTA) like protein  44.19 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.206813  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1424  gene transfer agent (GTA) orfg10  40.21 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.151518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4973  gene transfer agent (GTA) orfg10  49.28 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.0000866578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1698  gene transfer agent (GTA) orfg10  54.55 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0203645  normal  0.306867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1984  gene transfer agent (GTA) orfg10  40.74 
 
 		 105 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1420  gene transfer agent (GTA) like protein  38.1 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1175  gene transfer agent (GTA) like protein  34.91 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.734376  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0595  hypothetical protein  63.64 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0596  hypothetical protein  63.64 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0913  hypothetical protein  64.52 
 
 		 105 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909835 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1346  hypothetical protein  49.28 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000547988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>