19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3909 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3909  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  196  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.576255  normal  0.0625808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1420  gene transfer agent (GTA) like protein  52.94 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4973  gene transfer agent (GTA) orfg10  49.46 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.0000866578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1066  hypothetical protein  51.47 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.131086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1818  gene transfer agent (GTA) like protein  50 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.206813  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1175  gene transfer agent (GTA) like protein  47.06 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.734376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1346  hypothetical protein  37.89 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000547988  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1984  gene transfer agent (GTA) orfg10  45.07 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508447 
 
 
-
 
NC_004310  BR0595  hypothetical protein  41.38 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1424  gene transfer agent (GTA) orfg10  48.72 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.151518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1698  gene transfer agent (GTA) orfg10  45.16 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0203645  normal  0.306867 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0596  hypothetical protein  40.23 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1420  gene transfer agent (GTA) orfg10  46.24 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3464  gene transfer agent (GTA) orfg10  45.07 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3162  gene transfer agent (GTA) like protein  50 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0433156  normal  0.0131384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0913  hypothetical protein  44.78 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2893  hypothetical protein  48.48 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.597202  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1138  hypothetical protein  48.48 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.561282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2474  hypothetical protein  46.97 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0542451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>