24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1066 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1066  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  206  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.131086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2169  hypothetical protein  57.47 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1640  hypothetical protein  59 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2474  hypothetical protein  58.02 
 
 		 172 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0542451  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1175  gene transfer agent (GTA) like protein  49 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.734376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1083  hypothetical protein  58.33 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0845642 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2893  hypothetical protein  60.71 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.597202  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_004310  BR0595  hypothetical protein  46.73 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0596  hypothetical protein  46.73 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1138  hypothetical protein  62.86 
 
 		 105 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.561282 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1420  gene transfer agent (GTA) like protein  46 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1818  gene transfer agent (GTA) like protein  47 
 
 		 111 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.206813  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3464  gene transfer agent (GTA) orfg10  44 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1984  gene transfer agent (GTA) orfg10  43 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0913  hypothetical protein  46 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909835 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1346  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000547988  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4973  gene transfer agent (GTA) orfg10  48 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.0000866578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1424  gene transfer agent (GTA) orfg10  47 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.151518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1698  gene transfer agent (GTA) orfg10  45.63 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0203645  normal  0.306867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3162  gene transfer agent (GTA) like protein  46.53 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0433156  normal  0.0131384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1420  gene transfer agent (GTA) orfg10  43.93 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2110  gene transfer agent (GTA) like protein  47 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000925586  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3909  hypothetical protein  51.47 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.576255  normal  0.0625808 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3126  hypothetical protein  40.91 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>