13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1347 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1347  gene transfer agent (GTA) orfg10  100 
 
 		 62 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000217924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3163  hypothetical protein  57.41 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  0.0124686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1819  hypothetical protein  55.36 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1176  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.829742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2111  hypothetical protein  50.91 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00358078  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3463  hypothetical protein  50.91 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0791609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1421  hypothetical protein  48.15 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1985  hypothetical protein  43.64 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767846  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1419  hypothetical protein  49.02 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518955  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1423  hypothetical protein  49.02 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0592329  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1084  hypothetical protein  44.44 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0473834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1697  hypothetical protein  49.02 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11211  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1641  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>