17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2168 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2168  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  136  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2892  hypothetical protein  58.06 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.35936  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1084  hypothetical protein  50.75 
 
 		 66 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0473834 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1641  hypothetical protein  51.67 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1067  hypothetical protein  47.46 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.126814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2111  hypothetical protein  47.54 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00358078  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2474  hypothetical protein  62.3 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0542451  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1139  hypothetical protein  58.73 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3463  hypothetical protein  43.75 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0791609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1819  hypothetical protein  41.94 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1985  hypothetical protein  39.34 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767846  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1176  hypothetical protein  36.76 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.829742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1697  hypothetical protein  44.26 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11211  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1423  hypothetical protein  44.26 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0592329  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1421  hypothetical protein  38.71 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1419  hypothetical protein  42.62 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518955  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1347  gene transfer agent (GTA) orfg10  42.59 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000217924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>