More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01767 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS01767  trimethylamine dehydrogenase oxidoreductase protein  100 
 
 
726 aa  1479    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.236863 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0381  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.22 
 
 
700 aa  694    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433776  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1285  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.19 
 
 
697 aa  725    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2964  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.71 
 
 
689 aa  727    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1934  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.48 
 
 
691 aa  743    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  hitchhiker  0.00000161131 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3262  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.67 
 
 
687 aa  691    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5960  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.23 
 
 
730 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0518214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0917  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.57 
 
 
734 aa  491  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.361155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0618  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.49 
 
 
723 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0579  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.42 
 
 
699 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3558  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.32 
 
 
653 aa  236  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.102726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4278  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.15 
 
 
661 aa  224  6e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3631  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.38 
 
 
650 aa  205  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453694  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3717  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  26.72 
 
 
674 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  25.69 
 
 
654 aa  194  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3858  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.9 
 
 
646 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0569722  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  26.7 
 
 
644 aa  189  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132179  normal  0.162387 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1770  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  26.78 
 
 
666 aa  187  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4279  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.21 
 
 
647 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.24 
 
 
706 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.566036  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2056  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  26.88 
 
 
668 aa  185  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00143237  normal  0.0776584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5997  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  27.86 
 
 
667 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00579337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1044  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.01 
 
 
665 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1983  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.76 
 
 
667 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4041  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  26.83 
 
 
680 aa  180  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.117135  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1488  NADH:flavin oxidoreductase  28.16 
 
 
656 aa  180  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2849  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.49 
 
 
677 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1865  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  28.79 
 
 
687 aa  177  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.715282  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3746  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  26.83 
 
 
680 aa  177  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0759587 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5066  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.41 
 
 
687 aa  176  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.671736  normal  0.0284931 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3300  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.56 
 
 
687 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789807  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3973  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.6 
 
 
671 aa  174  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4001  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27 
 
 
680 aa  174  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.504416  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1582  NADH-flavin oxidoreductase / NADH oxidase family protein  27.7 
 
 
687 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0276819  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0743  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  28.07 
 
 
687 aa  173  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1976  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  28.07 
 
 
687 aa  173  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0474  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  28.07 
 
 
687 aa  173  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.368918  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0707  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  28.07 
 
 
687 aa  173  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2110  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  28.07 
 
 
687 aa  173  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.889569  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0831  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  28.07 
 
 
687 aa  173  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1003  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  28.07 
 
 
687 aa  173  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4819  NADH:-lavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.72 
 
 
687 aa  173  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1849  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.01 
 
 
667 aa  171  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.107762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3398  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.57 
 
 
680 aa  171  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242456  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0058  stachydrine utilization oxidoreductase protein  28.57 
 
 
687 aa  171  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2572  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.46 
 
 
652 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000750697  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4053  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.34 
 
 
686 aa  167  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.697936  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2175  NADH oxidase  27.25 
 
 
685 aa  165  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.42 
 
 
680 aa  165  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3861  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.21 
 
 
651 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.05 
 
 
698 aa  164  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1303  NADH:flavin oxidoreductase  26.43 
 
 
671 aa  163  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292118  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0574  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.21 
 
 
687 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4685  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.57 
 
 
587 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4494  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.21 
 
 
687 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.231835  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65940  putative oxidoreductase  28.36 
 
 
648 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5019  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.04 
 
 
687 aa  162  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467216  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4043  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.05 
 
 
655 aa  161  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1743  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  26.87 
 
 
937 aa  160  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5203  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.18 
 
 
687 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4782  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  26.21 
 
 
686 aa  160  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0396  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  26 
 
 
686 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5721  putative oxidoreductase  28.26 
 
 
648 aa  160  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3286  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.18 
 
 
687 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.18 
 
 
687 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4753  N-methylproline demethylase, putative  25.29 
 
 
678 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0821533  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3549  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  26.76 
 
 
687 aa  158  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5223  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  25.07 
 
 
686 aa  158  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493589  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2254  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.47 
 
 
664 aa  157  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274029  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2421  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.22 
 
 
668 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0495  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  25.31 
 
 
686 aa  154  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2820  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.87 
 
 
650 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1197  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  25.74 
 
 
678 aa  152  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.415933  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4017  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  25.96 
 
 
686 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.662358  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8007  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  26.73 
 
 
686 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632121  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2869  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.43 
 
 
650 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0765  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  24.15 
 
 
646 aa  151  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564446  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4931  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.79 
 
 
641 aa  150  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156402  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4536  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.92 
 
 
682 aa  150  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.519189  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1479  NADH:flavin oxidoreductase  24.89 
 
 
650 aa  150  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2110  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  26.82 
 
 
725 aa  150  8e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.824421  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3142  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  26.25 
 
 
645 aa  148  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4825  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  24.14 
 
 
678 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5525  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  25.96 
 
 
686 aa  146  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215393  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2912  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  26.83 
 
 
650 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2449  2,4-dienoyl-CoA reductase  27.33 
 
 
674 aa  145  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.980511  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0310  oxidoreductase, FMN-binding  26.09 
 
 
686 aa  145  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.019532  hitchhiker  0.00413942 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4897  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  24.93 
 
 
686 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616438  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1514  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.43 
 
 
645 aa  144  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0331  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  26.09 
 
 
686 aa  145  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0907336  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3616  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  26.32 
 
 
711 aa  145  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.667421  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4887  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  24.96 
 
 
702 aa  144  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4819  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  26.22 
 
 
661 aa  144  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0333  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  25.63 
 
 
686 aa  144  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71260  putative FMN oxidoreductase  25.32 
 
 
686 aa  144  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4913  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  23.32 
 
 
678 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0309437  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3855  2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)  29.24 
 
 
672 aa  142  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.720902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2144  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  25.09 
 
 
671 aa  142  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000426277  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6185  putative FMN oxidoreductase  25.39 
 
 
686 aa  142  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.114781  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3207  hypothetical protein  26.56 
 
 
678 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.519422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>