29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2219 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3244  hypothetical protein  85.6 
 
 		 398 aa  657    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2219  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  791    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.576507  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2450  hypothetical protein  70.33 
 
 		 398 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0010  hypothetical protein  41.77 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.215513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0017  hypothetical protein  43.22 
 
 		 376 aa  239  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0357647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5294  hypothetical protein  41.32 
 
 		 404 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  0.193675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3188  hypothetical protein  64.67 
 
 		 409 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4439  hypothetical protein  51.79 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0430  hypothetical protein  64.33 
 
 		 426 aa  216  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512543  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0347  hypothetical protein  49 
 
 		 373 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2316  hypothetical protein  57.69 
 
 		 355 aa  207  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00383771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2080  hypothetical protein  60.12 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3254  hypothetical protein  53.99 
 
 		 353 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1649  hypothetical protein  56.84 
 
 		 447 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.633116  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1142  hypothetical protein  46.52 
 
 		 401 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1193  hypothetical protein  47.11 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1132  hypothetical protein  47.51 
 
 		 352 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1353  hypothetical protein  47.11 
 
 		 347 aa  189  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3572  hypothetical protein  51.24 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1297  hypothetical protein  60 
 
 		 424 aa  186  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1363  hypothetical protein  46.05 
 
 		 396 aa  186  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1203  hypothetical protein  46.05 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1003  hypothetical protein  62.58 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123613  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0945  hypothetical protein  62.58 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1735  hypothetical protein  50.83 
 
 		 446 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135244 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1541  hypothetical protein  49.72 
 
 		 446 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0421  hypothetical protein  65.87 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.775232  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0791  hypothetical protein  57.26 
 
 		 461 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4302  hypothetical protein  60.98 
 
 		 347 aa  156  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  hitchhiker  0.0071391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>