29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0421 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0421  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  768    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.775232  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4302  hypothetical protein  47.83 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  hitchhiker  0.0071391 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0010  hypothetical protein  48.44 
 
 		 400 aa  204  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.215513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0017  hypothetical protein  48.11 
 
 		 376 aa  201  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0357647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2450  hypothetical protein  47.28 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2316  hypothetical protein  69.67 
 
 		 355 aa  182  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00383771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3244  hypothetical protein  66.67 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2219  hypothetical protein  65.87 
 
 		 389 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.576507  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3572  hypothetical protein  61.79 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3188  hypothetical protein  63.78 
 
 		 409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0430  hypothetical protein  64 
 
 		 426 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5294  hypothetical protein  60.8 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  0.193675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2080  hypothetical protein  64.46 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1353  hypothetical protein  59.06 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1193  hypothetical protein  59.06 
 
 		 343 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1132  hypothetical protein  58.78 
 
 		 352 aa  159  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4439  hypothetical protein  62.2 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729607  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0347  hypothetical protein  55.94 
 
 		 373 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1363  hypothetical protein  51.22 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1203  hypothetical protein  56.72 
 
 		 396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1541  hypothetical protein  58.06 
 
 		 446 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1003  hypothetical protein  59.66 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123613  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1297  hypothetical protein  43.78 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0945  hypothetical protein  59.66 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3254  hypothetical protein  60.32 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1142  hypothetical protein  51.55 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0791  hypothetical protein  55.04 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1735  hypothetical protein  58.06 
 
 		 446 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1649  hypothetical protein  59.2 
 
 		 447 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.633116  normal  0.21923 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>