29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0347 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0347  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  731    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4439  hypothetical protein  57.77 
 
 
365 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0430  hypothetical protein  66.5 
 
 
426 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512543  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1353  hypothetical protein  57.4 
 
 
347 aa  238  9e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3254  hypothetical protein  60.81 
 
 
353 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2080  hypothetical protein  67.98 
 
 
417 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1193  hypothetical protein  56.09 
 
 
343 aa  236  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1649  hypothetical protein  53.79 
 
 
447 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.633116  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1132  hypothetical protein  55.6 
 
 
352 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1142  hypothetical protein  49.82 
 
 
401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2219  hypothetical protein  49 
 
 
389 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.576507  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2450  hypothetical protein  59.77 
 
 
398 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1203  hypothetical protein  43.82 
 
 
396 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3244  hypothetical protein  53.21 
 
 
398 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1363  hypothetical protein  52.7 
 
 
396 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0010  hypothetical protein  42.72 
 
 
400 aa  203  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.215513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0017  hypothetical protein  50.88 
 
 
376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0357647  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2316  hypothetical protein  40.06 
 
 
355 aa  196  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00383771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1541  hypothetical protein  57.76 
 
 
446 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1735  hypothetical protein  53.63 
 
 
446 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.135244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3188  hypothetical protein  54.55 
 
 
409 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3572  hypothetical protein  65.35 
 
 
396 aa  176  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159319  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1297  hypothetical protein  59.31 
 
 
424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0945  hypothetical protein  63.16 
 
 
433 aa  173  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1003  hypothetical protein  63.16 
 
 
433 aa  173  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5294  hypothetical protein  48.31 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  0.193675 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0791  hypothetical protein  57.14 
 
 
461 aa  159  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0421  hypothetical protein  55.94 
 
 
377 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.775232  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4302  hypothetical protein  42.92 
 
 
347 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  hitchhiker  0.0071391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>