30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1203 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1203  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  773    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1363  hypothetical protein  96.46 
 
 		 396 aa  667    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1142  hypothetical protein  82.59 
 
 		 401 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4439  hypothetical protein  54.43 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3254  hypothetical protein  52.94 
 
 		 353 aa  258  9e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1649  hypothetical protein  47.54 
 
 		 447 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.633116  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0430  hypothetical protein  68.54 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512543  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1193  hypothetical protein  58.23 
 
 		 343 aa  235  9e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1353  hypothetical protein  57.38 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2080  hypothetical protein  64.8 
 
 		 417 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1132  hypothetical protein  54 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0347  hypothetical protein  42.35 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2316  hypothetical protein  39.52 
 
 		 355 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00383771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2450  hypothetical protein  45.67 
 
 		 398 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3244  hypothetical protein  47.35 
 
 		 398 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2219  hypothetical protein  41.28 
 
 		 389 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.576507  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0010  hypothetical protein  45.27 
 
 		 400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.215513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0017  hypothetical protein  43.8 
 
 		 376 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0357647  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3188  hypothetical protein  68.07 
 
 		 409 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5294  hypothetical protein  47.09 
 
 		 404 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  0.193675 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0945  hypothetical protein  52.28 
 
 		 433 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1541  hypothetical protein  58.27 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1003  hypothetical protein  52.28 
 
 		 433 aa  168  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123613  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1297  hypothetical protein  59.03 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1735  hypothetical protein  57.55 
 
 		 446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4302  hypothetical protein  50.56 
 
 		 347 aa  163  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  hitchhiker  0.0071391 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0791  hypothetical protein  53.5 
 
 		 461 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0421  hypothetical protein  56.72 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.775232  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3572  hypothetical protein  58.68 
 
 		 396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3437  flagellar motor switch protein FliM  29.75 
 
 		 325 aa  43.1  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>