28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1541 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1735  hypothetical protein  84.34 
 
 
446 aa  714    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.135244 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1541  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  893    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1297  hypothetical protein  37.72 
 
 
424 aa  217  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0945  hypothetical protein  37.61 
 
 
433 aa  216  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1003  hypothetical protein  38.07 
 
 
433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123613  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0017  hypothetical protein  54.19 
 
 
376 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0357647  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3572  hypothetical protein  41.79 
 
 
396 aa  192  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159319  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0010  hypothetical protein  53.04 
 
 
400 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.215513 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0791  hypothetical protein  45.45 
 
 
461 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0347  hypothetical protein  53.63 
 
 
373 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4439  hypothetical protein  60.62 
 
 
365 aa  186  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729607  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1193  hypothetical protein  65.65 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1353  hypothetical protein  65.65 
 
 
347 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0430  hypothetical protein  59.01 
 
 
426 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512543  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2316  hypothetical protein  47.18 
 
 
355 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00383771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1649  hypothetical protein  46.75 
 
 
447 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.633116  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1132  hypothetical protein  63.43 
 
 
352 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2450  hypothetical protein  56.6 
 
 
398 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3244  hypothetical protein  55.77 
 
 
398 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2219  hypothetical protein  49.72 
 
 
389 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.576507  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1142  hypothetical protein  55.11 
 
 
401 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2080  hypothetical protein  61.19 
 
 
417 aa  173  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3188  hypothetical protein  57.55 
 
 
409 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5294  hypothetical protein  54.78 
 
 
404 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  0.193675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1363  hypothetical protein  58.27 
 
 
396 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1203  hypothetical protein  58.27 
 
 
396 aa  167  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0421  hypothetical protein  58.06 
 
 
377 aa  156  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.775232  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4302  hypothetical protein  55.83 
 
 
347 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  hitchhiker  0.0071391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>