29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0791 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0791  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  926    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1735  hypothetical protein  55.9 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135244 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1297  hypothetical protein  50.52 
 
 		 424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1541  hypothetical protein  54.37 
 
 		 446 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0945  hypothetical protein  53.76 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1003  hypothetical protein  53.76 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3572  hypothetical protein  55.17 
 
 		 396 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1142  hypothetical protein  54.78 
 
 		 401 aa  163  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2219  hypothetical protein  57.26 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.576507  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1353  hypothetical protein  59.84 
 
 		 347 aa  159  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1193  hypothetical protein  59.84 
 
 		 343 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1203  hypothetical protein  53.5 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0347  hypothetical protein  57.14 
 
 		 373 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1363  hypothetical protein  53.5 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2316  hypothetical protein  59.66 
 
 		 355 aa  158  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00383771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1649  hypothetical protein  49.69 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.633116  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2450  hypothetical protein  59.17 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3244  hypothetical protein  56.67 
 
 		 398 aa  156  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0421  hypothetical protein  55.04 
 
 		 377 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.775232  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1132  hypothetical protein  57.85 
 
 		 352 aa  153  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4439  hypothetical protein  57.5 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0430  hypothetical protein  57.5 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5294  hypothetical protein  57.5 
 
 		 404 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  0.193675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2080  hypothetical protein  56.67 
 
 		 417 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3188  hypothetical protein  56.1 
 
 		 409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3254  hypothetical protein  40.08 
 
 		 353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0010  hypothetical protein  41.59 
 
 		 400 aa  147  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.215513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0017  hypothetical protein  51.05 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0357647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4302  hypothetical protein  51.26 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  hitchhiker  0.0071391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>