29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1142 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1142  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  775    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1203  hypothetical protein  81.59 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1363  hypothetical protein  80.7 
 
 		 396 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4439  hypothetical protein  55.31 
 
 		 365 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729607  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1649  hypothetical protein  49.57 
 
 		 447 aa  256  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.633116  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3254  hypothetical protein  52.12 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0430  hypothetical protein  65.37 
 
 		 426 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512543  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1193  hypothetical protein  57.26 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1353  hypothetical protein  58.47 
 
 		 347 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2080  hypothetical protein  65.19 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1132  hypothetical protein  54.76 
 
 		 352 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0347  hypothetical protein  48.75 
 
 		 373 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2316  hypothetical protein  48.25 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00383771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2219  hypothetical protein  54.65 
 
 		 389 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.576507  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3244  hypothetical protein  55.23 
 
 		 398 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2450  hypothetical protein  52.75 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0010  hypothetical protein  44.86 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.215513 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1541  hypothetical protein  55.17 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3188  hypothetical protein  54.39 
 
 		 409 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1003  hypothetical protein  53.3 
 
 		 433 aa  176  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123613  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0945  hypothetical protein  53.3 
 
 		 433 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1735  hypothetical protein  52.97 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135244 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0017  hypothetical protein  44.92 
 
 		 376 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0357647  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1297  hypothetical protein  53.8 
 
 		 424 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5294  hypothetical protein  55.03 
 
 		 404 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  0.193675 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0791  hypothetical protein  54.78 
 
 		 461 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4302  hypothetical protein  49.17 
 
 		 347 aa  156  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  hitchhiker  0.0071391 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0421  hypothetical protein  51.55 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.775232  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3572  hypothetical protein  57.85 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>