29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0430 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0430  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  822    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2080  hypothetical protein  81 
 
 		 417 aa  322  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4439  hypothetical protein  65.92 
 
 		 365 aa  308  9e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3254  hypothetical protein  65.69 
 
 		 353 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1353  hypothetical protein  59.66 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1142  hypothetical protein  50.28 
 
 		 401 aa  254  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1363  hypothetical protein  61.64 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1193  hypothetical protein  59.23 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1203  hypothetical protein  61.64 
 
 		 396 aa  250  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0347  hypothetical protein  64.22 
 
 		 373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1649  hypothetical protein  61.76 
 
 		 447 aa  246  6e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.633116  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1132  hypothetical protein  62.01 
 
 		 352 aa  243  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2219  hypothetical protein  57.47 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.576507  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3244  hypothetical protein  57.01 
 
 		 398 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2450  hypothetical protein  52.1 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2316  hypothetical protein  53.46 
 
 		 355 aa  209  7e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00383771 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0010  hypothetical protein  49 
 
 		 400 aa  205  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.215513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0017  hypothetical protein  51.8 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0357647  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3188  hypothetical protein  58.08 
 
 		 409 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1735  hypothetical protein  50.24 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135244 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1541  hypothetical protein  47.33 
 
 		 446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3572  hypothetical protein  65.83 
 
 		 396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5294  hypothetical protein  47.96 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  0.193675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1297  hypothetical protein  60.56 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0945  hypothetical protein  68.6 
 
 		 433 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1003  hypothetical protein  68.6 
 
 		 433 aa  166  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123613  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0421  hypothetical protein  65.29 
 
 		 377 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.775232  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4302  hypothetical protein  48.17 
 
 		 347 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  hitchhiker  0.0071391 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0791  hypothetical protein  57.5 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>