29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1132 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1132  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  674    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1193  hypothetical protein  79.26 
 
 		 343 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1353  hypothetical protein  78.65 
 
 		 347 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4439  hypothetical protein  64.73 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3254  hypothetical protein  62.04 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0430  hypothetical protein  64.19 
 
 		 426 aa  256  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2080  hypothetical protein  68.48 
 
 		 417 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1142  hypothetical protein  51.94 
 
 		 401 aa  245  8e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0347  hypothetical protein  63.49 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1203  hypothetical protein  55.38 
 
 		 396 aa  232  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1363  hypothetical protein  55.6 
 
 		 396 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1649  hypothetical protein  58.26 
 
 		 447 aa  228  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.633116  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0010  hypothetical protein  49.25 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.215513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3244  hypothetical protein  51.12 
 
 		 398 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2219  hypothetical protein  50.45 
 
 		 389 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.576507  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2316  hypothetical protein  52.04 
 
 		 355 aa  196  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00383771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0017  hypothetical protein  50.23 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0357647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2450  hypothetical protein  48.44 
 
 		 398 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1541  hypothetical protein  57.86 
 
 		 446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1735  hypothetical protein  57.23 
 
 		 446 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3188  hypothetical protein  52.91 
 
 		 409 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5294  hypothetical protein  53.9 
 
 		 404 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  0.193675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3572  hypothetical protein  60.77 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0945  hypothetical protein  61.36 
 
 		 433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1003  hypothetical protein  61.36 
 
 		 433 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123613  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1297  hypothetical protein  60.31 
 
 		 424 aa  162  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0421  hypothetical protein  47.64 
 
 		 377 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.775232  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0791  hypothetical protein  56.35 
 
 		 461 aa  155  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4302  hypothetical protein  48.44 
 
 		 347 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  hitchhiker  0.0071391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>