29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1649 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1649  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  863    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.633116  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1142  hypothetical protein  50.57 
 
 
401 aa  266  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4439  hypothetical protein  60.07 
 
 
365 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3254  hypothetical protein  63.1 
 
 
353 aa  254  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1363  hypothetical protein  57.66 
 
 
396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1203  hypothetical protein  56.91 
 
 
396 aa  245  9e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0430  hypothetical protein  65.02 
 
 
426 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2080  hypothetical protein  63.78 
 
 
417 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0347  hypothetical protein  48.3 
 
 
373 aa  226  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1353  hypothetical protein  56.03 
 
 
347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1193  hypothetical protein  56.44 
 
 
343 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1132  hypothetical protein  56.76 
 
 
352 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2219  hypothetical protein  59.43 
 
 
389 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.576507  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2450  hypothetical protein  54.55 
 
 
398 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3244  hypothetical protein  53.6 
 
 
398 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0017  hypothetical protein  50.44 
 
 
376 aa  190  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0357647  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2316  hypothetical protein  50.45 
 
 
355 aa  189  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00383771 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0010  hypothetical protein  49.55 
 
 
400 aa  188  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.215513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3188  hypothetical protein  57.47 
 
 
409 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1541  hypothetical protein  48.16 
 
 
446 aa  183  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1735  hypothetical protein  53.49 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.135244 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1003  hypothetical protein  57.49 
 
 
433 aa  166  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3572  hypothetical protein  60.98 
 
 
396 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159319  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0945  hypothetical protein  57.49 
 
 
433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5294  hypothetical protein  61.98 
 
 
404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  0.193675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1297  hypothetical protein  55.42 
 
 
424 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0791  hypothetical protein  40 
 
 
461 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0421  hypothetical protein  43.81 
 
 
377 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.775232  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4302  hypothetical protein  59.02 
 
 
347 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  hitchhiker  0.0071391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>