More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2588 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_2588  phosphopantetheine adenylyltransferase  100 
 
 
165 aa  337  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14268  normal  0.384811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2598  phosphopantetheine adenylyltransferase  83.64 
 
 
165 aa  288  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550477  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2874  phosphopantetheine adenylyltransferase  84.24 
 
 
165 aa  286  8e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.226706  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2871  phosphopantetheine adenylyltransferase  82.32 
 
 
169 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.658562  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1766  phosphopantetheine adenylyltransferase  80.61 
 
 
165 aa  271  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66348  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1799  phosphopantetheine adenylyltransferase  78.79 
 
 
165 aa  268  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195414  normal  0.107346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4369  phosphopantetheine adenylyltransferase  75.46 
 
 
164 aa  254  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.223414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5193  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.41 
 
 
166 aa  218  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5087  phosphopantetheine adenylyltransferase  64.81 
 
 
167 aa  217  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3787  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  64.2 
 
 
169 aa  216  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.403122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2150  phosphopantetheine adenylyltransferase  64.63 
 
 
167 aa  215  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198888  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4569  phosphopantetheine adenylyltransferase  64.81 
 
 
167 aa  213  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.967829  normal  0.107284 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5029  phosphopantetheine adenylyltransferase  64.81 
 
 
167 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0456512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1748  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.03 
 
 
164 aa  209  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4459  phosphopantetheine adenylyltransferase  64.63 
 
 
166 aa  206  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1934  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.13 
 
 
164 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2445  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.5 
 
 
164 aa  199  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1095  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.38 
 
 
164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.756098  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1056  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.38 
 
 
164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1264  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.59 
 
 
181 aa  194  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00933319  normal  0.787413 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1402  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.02 
 
 
166 aa  193  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2344  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.94 
 
 
167 aa  191  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2180  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.5 
 
 
164 aa  187  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0738  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.25 
 
 
169 aa  177  7e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105274  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3551  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.7 
 
 
167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3050  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.95 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.490282  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1178  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45.64 
 
 
169 aa  155  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1606  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.1 
 
 
162 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0491468 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2960  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.1 
 
 
162 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0216484  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1872  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.46 
 
 
162 aa  148  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0420385  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1392  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.48 
 
 
162 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.746303 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0541  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  42.68 
 
 
169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00492911  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2870  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.83 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0221222 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1744  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.48 
 
 
171 aa  145  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4969  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  42.94 
 
 
170 aa  144  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4476  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.36 
 
 
164 aa  143  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1736  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.12 
 
 
159 aa  141  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1322  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  39.26 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.125584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3575  phosphopantetheine adenylyltransferase  40 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.46415  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1916  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.72 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692935  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3723  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.31 
 
 
164 aa  138  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.172497 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1880  phosphopantetheine adenylyltransferase  36.71 
 
 
160 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641897  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1743  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.86 
 
 
172 aa  138  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.796142  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1109  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.89 
 
 
165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3599  CheW protein  42.33 
 
 
181 aa  137  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0853169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0066  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  42.24 
 
 
162 aa  137  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3516  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.64 
 
 
165 aa  136  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2252  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.38 
 
 
170 aa  136  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0603584  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2839  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.64 
 
 
165 aa  136  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.601234  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0256  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  42.94 
 
 
162 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.444043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2084  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.98 
 
 
161 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00311  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.13 
 
 
168 aa  135  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3926  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.46 
 
 
168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4091  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.62 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0380  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.67 
 
 
160 aa  134  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.848582  hitchhiker  0.0082896 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0208  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.96 
 
 
168 aa  134  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4107  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.12 
 
 
159 aa  134  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1243  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.76 
 
 
164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.235235  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5123  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.46 
 
 
161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2935  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.24 
 
 
167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4997  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.46 
 
 
159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2193  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.89 
 
 
168 aa  133  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  40 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2991  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.83 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00755722  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  40 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3983  phosphopantetheine adenylyltransferase  40 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.119096 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2655  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.24 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0121775 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1434  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.68 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03491  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.18 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0071  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  38.18 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0326  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.13 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.688108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1930  coenzyme A biosynthesis protein  41.46 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0452277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0115  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.86 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.71709  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0077  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.18 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000860074  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0359  coenzyme A biosynthesis protein  39.38 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.127481 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4191  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.24 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3843  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.18 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000107042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2411  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.37 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136029  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03443  hypothetical protein  38.18 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0511611  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4059  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.18 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000154368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2065  phosphopantetheine adenylyltransferase  40 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0496665  normal  0.697184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3969  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.18 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000330277  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4135  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.18 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5004  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.18 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000254595  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0417  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  39.63 
 
 
159 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4758  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.63 
 
 
159 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0794015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5348  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.85 
 
 
159 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0914491  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3620  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.88 
 
 
162 aa  132  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.870553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1667  coenzyme A biosynthesis protein  44.03 
 
 
166 aa  131  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1466  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  40.38 
 
 
153 aa  132  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0590  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.27 
 
 
170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2318  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.16 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1759  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.79 
 
 
163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282683  normal  0.0728276 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0023  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.75 
 
 
165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3942  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.02 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.137281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4368  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  43.83 
 
 
167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2007  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.62 
 
 
166 aa  131  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1871  phosphopantetheine adenylyltransferase  37.27 
 
 
160 aa  131  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2741  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.12 
 
 
168 aa  131  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1732  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.41 
 
 
164 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>