More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3551 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3551  phosphopantetheine adenylyltransferase  100 
 
 
167 aa  340  7e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2344  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.37 
 
 
167 aa  206  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_004310  BR1095  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.79 
 
 
164 aa  192  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.756098  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1056  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.79 
 
 
164 aa  192  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1402  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.01 
 
 
166 aa  190  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5193  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.49 
 
 
166 aa  189  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1264  phosphopantetheine adenylyltransferase  60 
 
 
181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00933319  normal  0.787413 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2871  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.64 
 
 
169 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.658562  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5087  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.12 
 
 
167 aa  187  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5029  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.63 
 
 
167 aa  186  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0456512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4569  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.63 
 
 
167 aa  186  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.967829  normal  0.107284 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2180  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.56 
 
 
164 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1766  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.79 
 
 
165 aa  185  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66348  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2150  phosphopantetheine adenylyltransferase  60 
 
 
167 aa  183  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198888  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2445  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.02 
 
 
164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1934  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.59 
 
 
164 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1799  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.56 
 
 
165 aa  180  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195414  normal  0.107346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2874  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.56 
 
 
165 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.226706  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1748  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.96 
 
 
164 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4459  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.02 
 
 
166 aa  179  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4369  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.56 
 
 
164 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.223414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3787  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  56.88 
 
 
169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.403122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2598  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.94 
 
 
165 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550477  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0738  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.9 
 
 
169 aa  176  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105274  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2588  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.7 
 
 
165 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14268  normal  0.384811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3050  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  49.34 
 
 
170 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.490282  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1322  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  44.38 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.125584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2870  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.62 
 
 
162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0221222 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0256  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  47.83 
 
 
162 aa  141  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.444043  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0541  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  44.67 
 
 
169 aa  141  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00492911  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2115  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.06 
 
 
164 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1732  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.06 
 
 
164 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2205  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.06 
 
 
164 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0163  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.3 
 
 
159 aa  140  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1109  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.23 
 
 
165 aa  140  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4476  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.95 
 
 
164 aa  140  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1606  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.06 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0491468 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0105  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.29 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00317746  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2960  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.06 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0216484  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4385  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.03 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1613  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.74 
 
 
165 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00264254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1640  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.75 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000016077  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1392  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.06 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.746303 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3692  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.59 
 
 
158 aa  138  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1872  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.59 
 
 
162 aa  138  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0420385  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0272  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.64 
 
 
167 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.373384  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1982  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.12 
 
 
164 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0245  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.64 
 
 
167 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1700  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.12 
 
 
164 aa  137  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.880065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3956  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.21 
 
 
159 aa  137  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.265028  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1880  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.02 
 
 
160 aa  137  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641897  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1178  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  43.14 
 
 
169 aa  136  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1744  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.95 
 
 
171 aa  136  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03491  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.74 
 
 
159 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0071  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  40.74 
 
 
159 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03443  hypothetical protein  40.74 
 
 
159 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0511611  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3843  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.74 
 
 
159 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000107042  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4059  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.74 
 
 
159 aa  136  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000154368  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3969  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.74 
 
 
159 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000330277  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0077  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.74 
 
 
159 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000860074  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4135  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.74 
 
 
159 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131057  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1916  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.59 
 
 
165 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692935  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5004  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.74 
 
 
159 aa  136  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000254595  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0285  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.03 
 
 
161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30794  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1434  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.82 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0338  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.65 
 
 
161 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.660339  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1743  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.42 
 
 
172 aa  135  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.796142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0059  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.51 
 
 
159 aa  135  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000113354  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4095  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.59 
 
 
159 aa  134  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277222  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1591  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.25 
 
 
162 aa  135  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000200475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10140  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  43.21 
 
 
162 aa  134  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.089106  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0186  phosphopantetheine adenylyltransferase  40 
 
 
162 aa  134  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001814  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.39 
 
 
161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.313981  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0065  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.51 
 
 
159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000149443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4151  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.51 
 
 
159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000257789  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3924  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.85 
 
 
159 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00616053  hitchhiker  0.00140553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4005  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.85 
 
 
159 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0403849  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4112  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.85 
 
 
159 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.017297  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4051  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.85 
 
 
159 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.979837  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00659  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.13 
 
 
159 aa  133  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1793  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.46 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.162855  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0392  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.46 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.147516  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0298  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  44.44 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49145  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0390  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.03 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.98 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3942  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.24 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.137281  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2252  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.59 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0603584  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1564  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  42.86 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2655  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.1 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0121775 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4091  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.98 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0188  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.25 
 
 
161 aa  132  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0127125  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0076  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.59 
 
 
158 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.697492 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0176  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.12 
 
 
163 aa  131  3e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.98 
 
 
163 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3983  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.98 
 
 
163 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.119096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3575  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.13 
 
 
160 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.46415  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0590  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.02 
 
 
170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1736  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.38 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1227  phosphopantetheine adenylyltransferase  35.29 
 
 
167 aa  130  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00311  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.04 
 
 
168 aa  130  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>