More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1109 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1109  phosphopantetheine adenylyltransferase  100 
 
 
165 aa  331  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1744  phosphopantetheine adenylyltransferase  83.44 
 
 
171 aa  282  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1916  phosphopantetheine adenylyltransferase  81.88 
 
 
165 aa  272  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692935  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4476  phosphopantetheine adenylyltransferase  80.49 
 
 
164 aa  266  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1606  phosphopantetheine adenylyltransferase  84.21 
 
 
162 aa  258  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0491468 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2960  phosphopantetheine adenylyltransferase  84.21 
 
 
162 aa  258  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0216484  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1392  phosphopantetheine adenylyltransferase  83.55 
 
 
162 aa  257  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.746303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2870  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.29 
 
 
162 aa  216  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0221222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1872  phosphopantetheine adenylyltransferase  64.81 
 
 
162 aa  209  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0420385  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1178  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  63.58 
 
 
169 aa  202  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1743  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.63 
 
 
172 aa  190  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.796142  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2193  phosphopantetheine adenylyltransferase  60 
 
 
168 aa  189  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0541  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  58.39 
 
 
169 aa  186  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00492911  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0023  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.55 
 
 
165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2252  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.39 
 
 
170 aa  181  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0603584  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3050  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  48.17 
 
 
170 aa  169  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.490282  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1434  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.27 
 
 
164 aa  169  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0326  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.45 
 
 
170 aa  163  9e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.688108 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0359  coenzyme A biosynthesis protein  48.45 
 
 
170 aa  163  9e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.127481 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10020  Phosphopantetheine adenylyltransferase  45.06 
 
 
159 aa  159  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000130207  hitchhiker  0.000000322675 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0091  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  54.37 
 
 
163 aa  157  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0310  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.69 
 
 
168 aa  157  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426352  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0245  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.61 
 
 
167 aa  157  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0272  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.61 
 
 
167 aa  157  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.373384  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0390  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.3 
 
 
168 aa  156  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1736  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.29 
 
 
159 aa  156  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1667  coenzyme A biosynthesis protein  50 
 
 
166 aa  156  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4138  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.47 
 
 
171 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0580  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.47 
 
 
171 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049418  normal  0.0168021 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0066  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  49.37 
 
 
162 aa  155  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0524  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.87 
 
 
168 aa  155  2e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3723  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.32 
 
 
164 aa  155  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.172497 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1227  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.54 
 
 
167 aa  155  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0338  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
161 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.660339  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0380  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.53 
 
 
160 aa  155  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.848582  hitchhiker  0.0082896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6137  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.47 
 
 
165 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109378  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1930  coenzyme A biosynthesis protein  50 
 
 
159 aa  154  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0657875  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0494  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.77 
 
 
165 aa  154  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2725  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.77 
 
 
165 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.284056  normal  0.758583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2867  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.77 
 
 
165 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.506076  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1629  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.17 
 
 
165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.435366  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0285  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.39 
 
 
161 aa  154  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30794  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2818  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.77 
 
 
165 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795983  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2193  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.77 
 
 
165 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2807  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.77 
 
 
165 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3125  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.47 
 
 
166 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23823  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3516  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.15 
 
 
165 aa  153  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0748  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.47 
 
 
166 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.82241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0580  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.47 
 
 
166 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1322  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.67 
 
 
163 aa  152  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.125584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1497  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.47 
 
 
166 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0469  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.47 
 
 
166 aa  153  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0737  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.16 
 
 
165 aa  153  1e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.724641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0342  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.75 
 
 
159 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2839  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.15 
 
 
165 aa  153  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.601234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0564  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.47 
 
 
166 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00247535  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2925  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.47 
 
 
166 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0093  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.47 
 
 
166 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5123  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.45 
 
 
161 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1924  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.56 
 
 
165 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4997  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.75 
 
 
159 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4969  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45.68 
 
 
170 aa  152  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0590  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.91 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3502  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  49.38 
 
 
166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000195906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5173  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.12 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00311  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.32 
 
 
168 aa  151  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0329  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.48 
 
 
162 aa  151  4e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.711951  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1930  coenzyme A biosynthesis protein  48.75 
 
 
160 aa  151  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0452277  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3224  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.45 
 
 
166 aa  150  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4368  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.88 
 
 
167 aa  151  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2992  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  47.24 
 
 
168 aa  151  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3034  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  47.24 
 
 
168 aa  151  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.677052  normal  0.536171 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0737  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.8 
 
 
160 aa  150  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.564198 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1168  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.01 
 
 
165 aa  150  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal  0.219485 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3620  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.47 
 
 
162 aa  150  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.870553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3575  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.5 
 
 
160 aa  150  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.46415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04760  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.37 
 
 
159 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0417  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  48.73 
 
 
159 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0609  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.47 
 
 
168 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4758  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.73 
 
 
159 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0794015 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1803  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.25 
 
 
171 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0457  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.37 
 
 
183 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2734  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.45 
 
 
165 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.715247  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5087  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.21 
 
 
167 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0076  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.37 
 
 
158 aa  148  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.697492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4765  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.88 
 
 
167 aa  148  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1550  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.68 
 
 
169 aa  148  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0805117  normal  0.396809 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0115  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.68 
 
 
158 aa  148  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0213  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.39 
 
 
156 aa  147  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1599  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.91 
 
 
186 aa  148  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0256  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  49.39 
 
 
162 aa  148  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.444043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0208  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.38 
 
 
168 aa  147  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3869  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  48.12 
 
 
167 aa  147  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2309  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.07 
 
 
164 aa  147  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0298  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
162 aa  147  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1982  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.29 
 
 
164 aa  147  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.38 
 
 
163 aa  147  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3983  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.38 
 
 
163 aa  147  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.119096 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.06 
 
 
163 aa  147  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0268  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
162 aa  147  7e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.526112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>