More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1743 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1743  phosphopantetheine adenylyltransferase  100 
 
 
172 aa  350  7e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.796142  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1178  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  61.64 
 
 
169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0541  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  60.37 
 
 
169 aa  194  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00492911  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1744  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.49 
 
 
171 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2870  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.25 
 
 
162 aa  193  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0221222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1872  phosphopantetheine adenylyltransferase  60 
 
 
162 aa  192  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0420385  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1392  phosphopantetheine adenylyltransferase  60 
 
 
162 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.746303 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2960  phosphopantetheine adenylyltransferase  60 
 
 
162 aa  191  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0216484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1606  phosphopantetheine adenylyltransferase  60 
 
 
162 aa  191  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0491468 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1109  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.63 
 
 
165 aa  190  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4476  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.01 
 
 
164 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0023  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.56 
 
 
165 aa  179  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1916  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.04 
 
 
165 aa  176  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692935  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2252  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.32 
 
 
170 aa  174  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0603584  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2193  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.7 
 
 
168 aa  168  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3575  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.2 
 
 
160 aa  168  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.46415  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0737  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.62 
 
 
165 aa  167  6e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.724641  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3050  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  49.7 
 
 
170 aa  167  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.490282  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1871  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.75 
 
 
160 aa  167  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5123  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.93 
 
 
161 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0105  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.17 
 
 
159 aa  166  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00317746  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0329  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.55 
 
 
162 aa  166  2e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.711951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1276  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.54 
 
 
159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000385015  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00311  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.81 
 
 
168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1550  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.9 
 
 
169 aa  165  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0805117  normal  0.396809 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3692  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.96 
 
 
158 aa  164  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2992  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.71 
 
 
168 aa  164  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3034  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.71 
 
 
168 aa  164  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.677052  normal  0.536171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4997  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.94 
 
 
159 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00059  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.27 
 
 
162 aa  164  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1356  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  51.27 
 
 
160 aa  164  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0260197  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0567  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.08 
 
 
167 aa  164  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.631239  normal  0.0587686 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0115  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.97 
 
 
158 aa  163  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  52 
 
 
163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4191  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.62 
 
 
160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0256  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  54.9 
 
 
162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.444043  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0066  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  48.73 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0076  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.32 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.697492 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0163  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.68 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1880  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.84 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641897  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1667  coenzyme A biosynthesis protein  50.92 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0609  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.25 
 
 
168 aa  162  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0590  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.25 
 
 
170 aa  162  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0053  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.5 
 
 
160 aa  162  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1227  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.03 
 
 
167 aa  162  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0524  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.31 
 
 
168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5348  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.94 
 
 
159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0914491  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5173  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.31 
 
 
159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3956  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.02 
 
 
159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.265028  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0417  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50.63 
 
 
159 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4758  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.63 
 
 
159 aa  160  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0794015 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0298  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.63 
 
 
162 aa  160  6e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0068  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.33 
 
 
163 aa  160  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3926  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.69 
 
 
168 aa  160  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4276  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.33 
 
 
163 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4331  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.33 
 
 
163 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4471  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.33 
 
 
163 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0342  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.69 
 
 
159 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0268  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.63 
 
 
162 aa  160  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.526112  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4765  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  48.81 
 
 
167 aa  160  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0396  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.95 
 
 
180 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0208  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.63 
 
 
168 aa  159  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.65 
 
 
163 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3983  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.65 
 
 
163 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.119096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4091  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.65 
 
 
163 aa  160  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4684  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.33 
 
 
163 aa  159  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1783  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.88 
 
 
170 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0795216  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4107  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.68 
 
 
159 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1434  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.1 
 
 
164 aa  159  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0633  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
163 aa  158  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370419  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3620  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.85 
 
 
162 aa  158  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.870553  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3942  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.44 
 
 
159 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.137281  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2741  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.43 
 
 
168 aa  158  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04760  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
159 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1142  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.8 
 
 
160 aa  157  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1640  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.95 
 
 
166 aa  157  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000016077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3502  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  51.25 
 
 
166 aa  158  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000195906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0457  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
183 aa  157  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1675  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  49.06 
 
 
165 aa  157  7e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4051  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.83 
 
 
159 aa  157  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.979837  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3924  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.83 
 
 
159 aa  157  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00616053  hitchhiker  0.00140553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4005  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.83 
 
 
159 aa  157  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0403849  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4112  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.83 
 
 
159 aa  157  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.017297  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1803  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  49.1 
 
 
171 aa  157  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1243  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.3 
 
 
164 aa  157  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.235235  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03490  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.04 
 
 
159 aa  157  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3642  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  48.03 
 
 
160 aa  157  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1322  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45 
 
 
163 aa  157  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.125584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4838  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.25 
 
 
161 aa  157  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000302126  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0110  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  51.61 
 
 
189 aa  157  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.800905  normal  0.0383495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3516  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.09 
 
 
165 aa  156  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4095  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.94 
 
 
159 aa  156  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277222  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2309  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.31 
 
 
164 aa  156  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2839  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.09 
 
 
165 aa  156  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.601234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1599  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.75 
 
 
186 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4385  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.12 
 
 
163 aa  155  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2035  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  49.38 
 
 
179 aa  155  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4368  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50 
 
 
167 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3843  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.48 
 
 
159 aa  155  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000107042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5004  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.48 
 
 
159 aa  155  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000254595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>