More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2960 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1606  phosphopantetheine adenylyltransferase  100 
 
 
162 aa  323  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0491468 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2960  phosphopantetheine adenylyltransferase  100 
 
 
162 aa  323  5e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0216484  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1392  phosphopantetheine adenylyltransferase  98.15 
 
 
162 aa  320  6e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.746303 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4476  phosphopantetheine adenylyltransferase  83.33 
 
 
164 aa  269  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1744  phosphopantetheine adenylyltransferase  81.48 
 
 
171 aa  262  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1109  phosphopantetheine adenylyltransferase  84.21 
 
 
165 aa  258  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1916  phosphopantetheine adenylyltransferase  78.26 
 
 
165 aa  254  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692935  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2870  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.12 
 
 
162 aa  206  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0221222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1872  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.11 
 
 
162 aa  201  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0420385  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1743  phosphopantetheine adenylyltransferase  60 
 
 
172 aa  191  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.796142  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2252  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.64 
 
 
170 aa  186  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0603584  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2193  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.25 
 
 
168 aa  186  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0541  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  62.91 
 
 
169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00492911  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1178  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  64.86 
 
 
169 aa  179  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0023  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.88 
 
 
165 aa  174  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4969  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50.94 
 
 
170 aa  169  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3050  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  51.25 
 
 
170 aa  169  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.490282  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1434  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.49 
 
 
164 aa  164  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0076  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.96 
 
 
158 aa  159  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.697492 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0737  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
165 aa  157  5e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.724641  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0359  coenzyme A biosynthesis protein  49.36 
 
 
170 aa  157  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.127481 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.59 
 
 
163 aa  157  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4091  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.96 
 
 
163 aa  156  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.96 
 
 
163 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3983  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.96 
 
 
163 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.119096 
 
 
-
 
NC_002978  WD0524  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.93 
 
 
168 aa  155  3e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0329  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.77 
 
 
162 aa  155  3e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.711951  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3692  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.96 
 
 
158 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1736  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.1 
 
 
159 aa  154  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1599  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.75 
 
 
186 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0256  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50.94 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.444043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1322  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45.06 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.125584  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0110  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  51.92 
 
 
189 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.800905  normal  0.0383495 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0494  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
165 aa  154  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2725  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
165 aa  154  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.284056  normal  0.758583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2598  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.58 
 
 
165 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550477  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2867  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
165 aa  154  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.506076  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0326  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.08 
 
 
170 aa  153  8e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.688108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0580  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.38 
 
 
171 aa  153  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049418  normal  0.0168021 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1871  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.07 
 
 
160 aa  153  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0390  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.62 
 
 
168 aa  153  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6137  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.62 
 
 
165 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109378  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1667  coenzyme A biosynthesis protein  48.75 
 
 
166 aa  152  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0115  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.04 
 
 
158 aa  153  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4138  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.38 
 
 
171 aa  153  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0208  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.94 
 
 
168 aa  153  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3575  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.32 
 
 
160 aa  152  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.46415  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0066  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  49.04 
 
 
162 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2925  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
166 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3125  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
166 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2818  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.62 
 
 
165 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795983  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0748  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
166 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.82241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0580  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
166 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0469  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
166 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0093  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
166 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2193  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.62 
 
 
165 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1497  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
166 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1227  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.64 
 
 
167 aa  152  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1629  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.75 
 
 
165 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.435366  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3926  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.31 
 
 
168 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0564  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
166 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00247535  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2807  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.62 
 
 
165 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2411  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.3 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136029  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00311  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.92 
 
 
168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0272  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.373384  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1930  coenzyme A biosynthesis protein  49.68 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0657875  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0245  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0338  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.62 
 
 
161 aa  151  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.660339  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1924  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.12 
 
 
165 aa  151  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4107  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.06 
 
 
159 aa  151  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4368  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  47.5 
 
 
167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0310  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.38 
 
 
168 aa  150  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426352  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2874  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.58 
 
 
165 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.226706  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1675  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  52.45 
 
 
165 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5123  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.47 
 
 
161 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1783  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.5 
 
 
170 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0795216  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0091  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50.64 
 
 
163 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4684  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
163 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0417  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.84 
 
 
159 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4758  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.84 
 
 
159 aa  148  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0794015 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10020  Phosphopantetheine adenylyltransferase  44.1 
 
 
159 aa  149  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000130207  hitchhiker  0.000000322675 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0380  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.91 
 
 
160 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.848582  hitchhiker  0.0082896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4997  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.47 
 
 
159 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0285  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
161 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30794  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2839  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.1 
 
 
165 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.601234  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3516  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.1 
 
 
165 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0173  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.75 
 
 
253 aa  148  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000768872 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1930  coenzyme A biosynthesis protein  49.04 
 
 
160 aa  148  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0452277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1000  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.65 
 
 
169 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000348032  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3642  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  44.72 
 
 
160 aa  148  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2309  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.31 
 
 
164 aa  148  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0342  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.84 
 
 
159 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0071  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45.86 
 
 
159 aa  147  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3969  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.86 
 
 
159 aa  147  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000330277  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4135  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.86 
 
 
159 aa  147  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131057  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0970  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  49.66 
 
 
161 aa  147  6e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.913045  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1109  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.58 
 
 
165 aa  147  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.586457  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0077  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.86 
 
 
159 aa  147  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000860074  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5004  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.86 
 
 
159 aa  147  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000254595  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4059  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.86 
 
 
159 aa  147  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000154368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>