More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5193 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5193  phosphopantetheine adenylyltransferase  100 
 
 
166 aa  332  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4459  phosphopantetheine adenylyltransferase  92.17 
 
 
166 aa  290  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4569  phosphopantetheine adenylyltransferase  85.37 
 
 
167 aa  286  7e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.967829  normal  0.107284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5087  phosphopantetheine adenylyltransferase  87.65 
 
 
167 aa  286  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5029  phosphopantetheine adenylyltransferase  85.37 
 
 
167 aa  285  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0456512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2150  phosphopantetheine adenylyltransferase  82.93 
 
 
167 aa  276  8e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198888  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1799  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.85 
 
 
165 aa  233  8e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195414  normal  0.107346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3787  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  66.87 
 
 
169 aa  233  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.403122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2874  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.07 
 
 
165 aa  228  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.226706  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1766  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.46 
 
 
165 aa  228  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66348  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4369  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.03 
 
 
164 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.223414 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2598  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.41 
 
 
165 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550477  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2871  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.41 
 
 
169 aa  219  9e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.658562  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1095  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.01 
 
 
164 aa  210  7e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.756098  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1056  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.01 
 
 
164 aa  210  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1748  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.89 
 
 
164 aa  210  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2588  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.41 
 
 
165 aa  207  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14268  normal  0.384811 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1402  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.35 
 
 
166 aa  206  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1934  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.26 
 
 
164 aa  205  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1264  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.64 
 
 
181 aa  204  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00933319  normal  0.787413 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2180  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.01 
 
 
164 aa  204  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2445  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.01 
 
 
164 aa  200  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2344  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.63 
 
 
167 aa  193  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0738  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.6 
 
 
169 aa  184  4e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105274  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3551  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.49 
 
 
167 aa  174  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3050  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  49.7 
 
 
170 aa  167  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.490282  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1178  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  43.21 
 
 
169 aa  149  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1743  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.01 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.796142  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4476  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.17 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1744  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.12 
 
 
171 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0541  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  42.24 
 
 
169 aa  144  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00492911  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1109  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.56 
 
 
165 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4191  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.85 
 
 
160 aa  143  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4997  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.24 
 
 
159 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2870  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.17 
 
 
162 aa  143  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0221222 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5123  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.24 
 
 
161 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0342  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.85 
 
 
159 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1434  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.86 
 
 
164 aa  142  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1736  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.26 
 
 
159 aa  141  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1872  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.07 
 
 
162 aa  140  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0420385  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5173  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.64 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5348  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.24 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0914491  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4758  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.24 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0794015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3575  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.88 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.46415  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1916  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.42 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692935  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0417  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  43.64 
 
 
159 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03491  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.46 
 
 
159 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0071  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  41.46 
 
 
159 aa  137  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4059  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.46 
 
 
159 aa  137  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000154368  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03443  hypothetical protein  41.46 
 
 
159 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0511611  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3843  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.46 
 
 
159 aa  137  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000107042  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3969  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.46 
 
 
159 aa  137  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000330277  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0077  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.46 
 
 
159 aa  137  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000860074  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5004  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.46 
 
 
159 aa  137  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000254595  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4135  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.46 
 
 
159 aa  137  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131057  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0329  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.13 
 
 
162 aa  136  1e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.711951  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0023  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.72 
 
 
165 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2252  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.61 
 
 
170 aa  135  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0603584  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04760  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.03 
 
 
159 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0737  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.1 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.724641  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1793  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.82 
 
 
159 aa  134  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.162855  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2193  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.72 
 
 
168 aa  135  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0392  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.82 
 
 
159 aa  134  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.147516  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1392  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.1 
 
 
162 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.746303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0457  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.03 
 
 
183 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3692  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.36 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2960  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.1 
 
 
162 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0216484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1732  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.57 
 
 
164 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1606  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.1 
 
 
162 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0491468 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2205  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.57 
 
 
164 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2115  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.57 
 
 
164 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03490  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.33 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0004  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  44.38 
 
 
162 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0066  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  42.07 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1322  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  38.51 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.125584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0256  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  44.1 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.444043  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3942  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.88 
 
 
159 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.137281  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3516  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.86 
 
 
165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2839  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.86 
 
 
165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.601234  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2655  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.67 
 
 
174 aa  131  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0121775 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0208  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.07 
 
 
168 aa  130  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4385  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.55 
 
 
163 aa  130  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3926  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.82 
 
 
168 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4005  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.25 
 
 
159 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0403849  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4112  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.25 
 
 
159 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.017297  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4051  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.25 
 
 
159 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.979837  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3924  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.25 
 
 
159 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00616053  hitchhiker  0.00140553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2065  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.46 
 
 
165 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0496665  normal  0.697184 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0106  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  37.35 
 
 
161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0691876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3502  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  44.03 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000195906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4091  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.1 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0068  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.31 
 
 
163 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10840  Phosphopantetheine adenylyltransferase  45.06 
 
 
157 aa  128  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00154659  normal  0.121737 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14961  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.36 
 
 
157 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0163  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.79 
 
 
159 aa  128  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0076  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.74 
 
 
158 aa  128  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.697492 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.1 
 
 
163 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3983  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.1 
 
 
163 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.119096 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08801  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.25 
 
 
157 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000960549 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1227  phosphopantetheine adenylyltransferase  34.42 
 
 
167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>