More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1744 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1744  phosphopantetheine adenylyltransferase  100 
 
 
171 aa  346  9e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1109  phosphopantetheine adenylyltransferase  83.44 
 
 
165 aa  282  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1916  phosphopantetheine adenylyltransferase  80.12 
 
 
165 aa  270  8.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692935  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2960  phosphopantetheine adenylyltransferase  81.48 
 
 
162 aa  262  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0216484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1606  phosphopantetheine adenylyltransferase  81.48 
 
 
162 aa  262  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0491468 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1392  phosphopantetheine adenylyltransferase  80.86 
 
 
162 aa  261  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.746303 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4476  phosphopantetheine adenylyltransferase  79.01 
 
 
164 aa  260  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2870  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.05 
 
 
162 aa  204  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0221222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1743  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.49 
 
 
172 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.796142  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1872  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.88 
 
 
162 aa  192  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0420385  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1178  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  58.9 
 
 
169 aa  190  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2193  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.01 
 
 
168 aa  184  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0023  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.14 
 
 
165 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2252  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.75 
 
 
170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0603584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0541  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  57.76 
 
 
169 aa  180  9.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00492911  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3050  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.490282  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1434  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.88 
 
 
164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1322  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  47.24 
 
 
163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.125584  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0066  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50 
 
 
162 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0737  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.52 
 
 
165 aa  160  8.000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.724641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1736  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.24 
 
 
159 aa  159  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0329  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.77 
 
 
162 aa  157  6e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.711951  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0524  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.31 
 
 
168 aa  155  2e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0076  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.63 
 
 
158 aa  155  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.697492 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0359  coenzyme A biosynthesis protein  47.17 
 
 
170 aa  155  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.127481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4969  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  48.12 
 
 
170 aa  155  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0208  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.7 
 
 
168 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1227  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.45 
 
 
167 aa  154  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0115  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.64 
 
 
158 aa  154  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3926  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.23 
 
 
168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00311  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.68 
 
 
168 aa  153  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4107  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.37 
 
 
159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3942  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.8 
 
 
159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.137281  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1880  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.06 
 
 
160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641897  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0590  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.37 
 
 
170 aa  151  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0326  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.91 
 
 
170 aa  151  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.688108 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0091  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50.94 
 
 
163 aa  151  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4369  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.58 
 
 
164 aa  151  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.223414 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0609  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.37 
 
 
168 aa  151  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2150  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.58 
 
 
167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198888  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3692  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.32 
 
 
158 aa  150  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4051  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.17 
 
 
159 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.979837  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3924  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.17 
 
 
159 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00616053  hitchhiker  0.00140553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4005  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.17 
 
 
159 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0403849  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4112  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.17 
 
 
159 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.017297  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0310  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.43 
 
 
168 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426352  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2871  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.34 
 
 
169 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.658562  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0970  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  48.05 
 
 
161 aa  150  1e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.913045  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1599  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.12 
 
 
186 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1550  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.77 
 
 
169 aa  149  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0805117  normal  0.396809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0580  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.58 
 
 
171 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049418  normal  0.0168021 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0380  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.33 
 
 
160 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.848582  hitchhiker  0.0082896 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0256  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  51.59 
 
 
162 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.444043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1930  coenzyme A biosynthesis protein  46.25 
 
 
160 aa  149  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0452277  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0298  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.73 
 
 
162 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1629  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.24 
 
 
165 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.435366  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4138  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.58 
 
 
171 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10020  Phosphopantetheine adenylyltransferase  41.36 
 
 
159 aa  149  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000130207  hitchhiker  0.000000322675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2411  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.34 
 
 
163 aa  149  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136029  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0268  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.73 
 
 
162 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.526112  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3620  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.94 
 
 
162 aa  149  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.870553  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0110  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  51.61 
 
 
189 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.800905  normal  0.0383495 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.03 
 
 
163 aa  148  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6137  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.83 
 
 
165 aa  148  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109378  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1930  coenzyme A biosynthesis protein  47.47 
 
 
159 aa  148  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0657875  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1871  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.63 
 
 
160 aa  149  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0105  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.54 
 
 
159 aa  148  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00317746  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.5 
 
 
163 aa  148  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3983  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.5 
 
 
163 aa  148  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.119096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4091  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.5 
 
 
163 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0068  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.33 
 
 
163 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03491  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.62 
 
 
159 aa  148  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0071  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45.62 
 
 
159 aa  148  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3969  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.62 
 
 
159 aa  148  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000330277  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4135  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.62 
 
 
159 aa  148  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5004  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.62 
 
 
159 aa  148  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000254595  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2725  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.83 
 
 
165 aa  148  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.284056  normal  0.758583 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3843  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.62 
 
 
159 aa  148  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000107042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0077  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.62 
 
 
159 aa  148  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000860074  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0494  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.83 
 
 
165 aa  148  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4471  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.67 
 
 
163 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2867  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.83 
 
 
165 aa  148  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.506076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03443  hypothetical protein  45.62 
 
 
159 aa  148  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0511611  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4059  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.62 
 
 
159 aa  148  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000154368  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0338  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.39 
 
 
161 aa  148  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.660339  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4331  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.67 
 
 
163 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4276  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.67 
 
 
163 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0390  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.24 
 
 
168 aa  147  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0245  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.47 
 
 
167 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2818  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.83 
 
 
165 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795983  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0272  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.47 
 
 
167 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.373384  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2193  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.83 
 
 
165 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2807  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.83 
 
 
165 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0213  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.97 
 
 
156 aa  147  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1276  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.44 
 
 
159 aa  147  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000385015  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1667  coenzyme A biosynthesis protein  46.54 
 
 
166 aa  147  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0748  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.83 
 
 
166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.82241  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0469  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.83 
 
 
166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0564  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.83 
 
 
166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00247535  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0580  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.83 
 
 
166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>