More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0380 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0380  phosphopantetheine adenylyltransferase  100 
 
 
160 aa  322  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.848582  hitchhiker  0.0082896 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2734  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.52 
 
 
165 aa  223  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.715247  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0285  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.52 
 
 
161 aa  221  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30794  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0390  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.88 
 
 
168 aa  221  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0338  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.88 
 
 
161 aa  219  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.660339  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0272  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.03 
 
 
167 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.373384  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0245  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.03 
 
 
167 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0737  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.67 
 
 
160 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.564198 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1930  coenzyme A biosynthesis protein  63.87 
 
 
159 aa  216  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0657875  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0564  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.06 
 
 
166 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00247535  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3125  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.06 
 
 
166 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0580  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.06 
 
 
166 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0748  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.06 
 
 
166 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.82241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2925  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.06 
 
 
166 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0469  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.06 
 
 
166 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1497  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.06 
 
 
166 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0093  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.06 
 
 
166 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2725  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.06 
 
 
165 aa  213  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.284056  normal  0.758583 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0494  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.06 
 
 
165 aa  213  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2867  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.06 
 
 
165 aa  213  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.506076  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0310  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.06 
 
 
168 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426352  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6137  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.42 
 
 
165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109378  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1667  coenzyme A biosynthesis protein  63.69 
 
 
166 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0580  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.42 
 
 
171 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049418  normal  0.0168021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4138  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.42 
 
 
171 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2193  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.42 
 
 
165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2807  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.42 
 
 
165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2818  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.42 
 
 
165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795983  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3723  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.33 
 
 
164 aa  209  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.172497 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1930  coenzyme A biosynthesis protein  64.74 
 
 
160 aa  209  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0452277  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1629  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.42 
 
 
165 aa  208  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.435366  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2839  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.34 
 
 
165 aa  207  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.601234  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3516  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.34 
 
 
165 aa  207  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5173  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.64 
 
 
159 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1924  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.42 
 
 
165 aa  206  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0342  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.01 
 
 
159 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4191  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.62 
 
 
160 aa  205  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5123  phosphopantetheine adenylyltransferase  60 
 
 
161 aa  204  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4997  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.38 
 
 
159 aa  203  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0417  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  61.39 
 
 
159 aa  203  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4758  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.39 
 
 
159 aa  203  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0794015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04760  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.13 
 
 
159 aa  203  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0457  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.04 
 
 
183 aa  202  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3620  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.87 
 
 
162 aa  201  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.870553  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03490  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.13 
 
 
159 aa  200  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3869  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  60.51 
 
 
167 aa  200  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4765  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  57.86 
 
 
167 aa  200  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0359  coenzyme A biosynthesis protein  61.44 
 
 
170 aa  199  9e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.127481 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3502  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  59.75 
 
 
166 aa  199  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000195906 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0091  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  61.29 
 
 
163 aa  199  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2655  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.15 
 
 
174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0121775 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0326  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.78 
 
 
170 aa  198  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.688108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5348  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  197  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0914491  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0066  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  63.19 
 
 
162 aa  196  7e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2309  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.86 
 
 
164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4368  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  58.86 
 
 
167 aa  194  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1803  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  57.32 
 
 
171 aa  194  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3599  CheW protein  60.26 
 
 
181 aa  192  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0853169 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3224  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.23 
 
 
166 aa  191  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2006  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  59.62 
 
 
169 aa  190  6e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.149824 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3926  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.49 
 
 
168 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4091  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.84 
 
 
163 aa  187  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3575  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.37 
 
 
160 aa  187  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.46415  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0298  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  64.86 
 
 
159 aa  187  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49145  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.84 
 
 
163 aa  187  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3983  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.84 
 
 
163 aa  187  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.119096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0076  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.56 
 
 
158 aa  187  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.697492 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0590  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.49 
 
 
170 aa  186  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0609  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.49 
 
 
168 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0208  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.19 
 
 
168 aa  185  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.19 
 
 
163 aa  185  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00059  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.9 
 
 
162 aa  185  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0115  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.33 
 
 
158 aa  186  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3692  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.25 
 
 
158 aa  184  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00311  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.76 
 
 
168 aa  184  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0053  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.21 
 
 
160 aa  183  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4107  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.9 
 
 
159 aa  183  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0110  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  56 
 
 
189 aa  183  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.800905  normal  0.0383495 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4684  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.46 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2935  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.14 
 
 
167 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0068  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.46 
 
 
163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4471  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.78 
 
 
163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4331  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.78 
 
 
163 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4276  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.78 
 
 
163 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4838  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.6 
 
 
161 aa  179  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000302126  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0065  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.3 
 
 
159 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000149443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4151  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.3 
 
 
159 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000257789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0059  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.27 
 
 
159 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000113354  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0548  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  55.26 
 
 
164 aa  177  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0213  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.26 
 
 
156 aa  176  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1142  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.1 
 
 
160 aa  173  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0115  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.31 
 
 
166 aa  173  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.71709  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1871  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.21 
 
 
160 aa  172  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0105  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.32 
 
 
159 aa  173  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00317746  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0186  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.68 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0298  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.84 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0268  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.49 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.526112  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2065  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.32 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0496665  normal  0.697184 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0188  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.8 
 
 
161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0127125  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3956  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.35 
 
 
159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.265028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>